基于PacBio SMRT技术研究四川红原人和牛肠道菌群结构

基于PacBio SMRT技术研究四川红原人和牛肠道菌群结构

论文摘要

栖息于人与动物肠道内数以万计的微生物,是影响宿主健康的潜在关键因素。本研究基于16S rRNA全长基因的单分子实时测序技术(SMRT),对红原县人和牛肠道微生物结构进行研究,并结合MG-RAST数据库中内蒙古锡林郭勒盟镶黄旗呼日敦高勒嘎查牧场人和牛肠道细菌基因序列,综合分析不同地区不同宿主的肠道菌群结构。结果表明,红原地区人肠道细菌群以Catenibacterium mitsuokai、Faecalibacterium prausnitzii为优势菌种,牛肠道优势菌种为Oscillibacter valericigenes、Eubacterium coprostanoligenes。α多样性结果表明,牛肠道菌群多样性显著高于人肠道(P<0.001);β多样性结果显示,人与牛样品分开聚类,表明不同宿主间肠道菌群结构差异显著。联合分析两地人、牛肠道细菌结构表明,物种不同是影响宿主肠道菌群结构差异的首要因素,其次是饮食和环境。本研究在"种"水平上对红原地区人和牛肠道菌群进行研究,为准确认识当地人畜肠道菌群特点,了解不同地区不同宿主肠道菌群的差异,进而开发出针对性益生菌产品提供数据支持。

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文章来源

类型: 国际会议

作者: 姚彩青,于洁,侯强川,靳昊,马腾,潘琳,莫蓝馨,安晓娜,王佼,孙志宏,张和平

关键词: 单分子实时测序,肠道菌群,细菌多样性,人与牛

来源: 第十四届益生菌与健康国际研讨会 2019-05-22

年度: 2019

分类: 基础科学,工程科技Ⅰ辑

专业: 生物学,轻工业手工业

单位: 内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室农业部奶制品加工重点实验室

分类号: TS201.3

页码: 77-78

总页数: 2

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