抗原多肽结合区论文-王瑞,李莉萍,黄婷,梁万文,甘西

抗原多肽结合区论文-王瑞,李莉萍,黄婷,梁万文,甘西

导读:本文包含了抗原多肽结合区论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:罗非鱼,热休克蛋白70,活性,免疫佐剂

抗原多肽结合区论文文献综述

王瑞,李莉萍,黄婷,梁万文,甘西[1](2013)在《重组罗非鱼Hsp70蛋白ATPase和抗原多肽结合活性研究》一文中研究指出热休克蛋白(Heat shock proteins,HSPs)是一类高度保守的蛋白,可被各种病理性和生理性应激诱导,保护组织免受应激带来的损伤[1]。其中Hsp70为HSPs中最保守、最重要、家族成员最多的一族,在大多数生物中含量也最多,在应激反应中也最敏感。Hsp70具有分子伴侣、抑制细胞凋亡、调节细胞增殖、免疫功能、使生物获得耐热性、抗氧化等多种生物学功能,成为HSPs中最受关注、研究最深入的一类[2]。Hsp70可与抗原结合形成Hsp70-(本文来源于《水生生物学报》期刊2013年04期)

丁艳[2](2012)在《肺结核患者外周γδT细胞Vδ2-CDR3序列特征及其合成多肽结合抗原肽的筛选和鉴定》一文中研究指出研究背景:许多研究已证实γδ T细胞在抗结核分枝杆菌(Mycobacteriumtuberculosis, Mtb)感染免疫中发挥重要作用。人γδ T细胞受体(TCRγδ)主要由Vγ9和Vδ2组成,在健康人外周血γδ T细胞中约80%为Vγ9δ2T细胞,已发现活动性结核病(TB)患者的外周Vγ9δ2T细胞数量和对Mtb抗原刺激的增殖活性均有明显降低。但是这类Vγ9δ2T细胞亚群在抗原识别以及克隆特征方面在TB患者和健康人之间有何不同,至今了解尚不完全。鉴于TCRγδ的γ或δ链V区的互补决定簇区3(CDR3)是识别抗原表位的关键位点,而目前对于TCRγδ所识别的Mtb抗原多肽表位也不完全清楚。因此从检测和分析TB患者γδ T细胞Vδ-CDR3基因谱型和序列特征,有助于理解γδ T细胞在抗原识别方面的克隆特征。另外根据TB患者的优势CDR3片段序列合成的肽片段,从噬菌体多肽展示库中筛选出Mtb相关性性的抗原表位。将有助于揭示γδ T细胞识别Mtb抗原表位的机制,为Mtb感染的诊断和防治提供新的方法。目的:检测和分析活动性肺TB患者外周血γδT细胞受体Vδ2链CDR3片段基因谱型和序列特征,应用Vδ2-CDR3优势片段序列合成肽在噬菌体多肽展示库中筛选Mtb抗原相关的多肽表位,并对合成的Mtb抗原多肽表位的激活人γδ T细胞活性进行初步鉴定。为阐明TB患者的T细胞免疫应答机制以及免疫诊断和治疗研究提供新的科学依据。方法:1.采集肺TB患者(n=27)和健康人(n=25)外周血分离PBMC提取RNA,用RT-PCR方法扩增TCRγδ的Vδ2基因CDR3片段,PCR产物通过基因扫描分析CDR3片段长度的多样性变化。2. Vδ2-CDR3的PCR产物纯化后连接PMD18-T载体重组质粒,转化及阳性筛选后用菌落PCR法对重组阳性质粒进行鉴定,并对阳性质粒PCR产物进行基因扫描分析确定其CDR3长度;3.对Vδ2-CDR3的PCR产物基因扫描优势峰对应的大部分重组质粒转化阳性克隆,以及部分非优势峰对应克隆的CDR3基因片段,测定DNA序列,并分析和比较其编码氨基酸的特征。4.从TB患者新鲜PBMC和正常人PBMC经Mtb耐热性抗原刺激增殖的T细胞扩增Vδ2-CDR3的最优势序列,合成多肽片段包被平板,加噬菌体7肽库温育后,先洗去未结合的噬菌体,然后洗脱并收获特异结合的噬菌体扩增。经3-4轮结合-淘选-扩增循环,富集特异性结合噬菌体,并经过DNA测序分析和ELISA验证阳性噬菌体,通过BLAST生物信息学分析和比对噬菌体展示多肽序列与Mtb抗原的相关性。5.从特异性富集噬菌体的多肽序列中寻找到的与Mtb相关的肽表位序列,合成7肽片段后作为抗原刺激正常人和TB患者的外周血PBMC,用流式细胞术检测γδ T细胞的增殖活性。结果:1对PBMC中TCRγδ的Vδ2-CDR3片段基因扫描结果显示:TB患者组(n=27)优势峰占总峰的比率(0.2755±0.0619)较正常人组(n=25)(0.1979±0.0346)高,TB患者组的长度变化范围为(25.11±5.52)较正常人为(19.87±3.52)高,差异均有统计学意义(p<0.0和p<0.0)。2TB患者TCRγδ的Vδ2-CDR3的片段数和最优势峰长度,与正常人比较无显着变化。3基因扫描分析显示CDR3转化阳性菌落PCR峰与CDR3的RT-PCR产物中的扫描峰有很好的对应关系;有意义的是最高频率菌落(占40%)的CDR3片段长度与PBMC的RT-PCR产物的基因扫描优势峰长度完全相同。4对CDR3转化的克隆(73个)的测序结果表明:TCR Vδ2–CDR3序列均由两端保守的侧翼序列和中间的多变序列组成;两端保守的侧翼序列由位于N端的“CACD”和位于C端的“KLIFGKG”组成,多变的中间序列97号位均含有疏水性氨基酸残基。该其中TB患者优势取用DJ3片段。每位TB患者有自己的优势序列,患者间偶发现有共有序列。5从TB患者新鲜PBMC中Vδ2-CDR3的优势序列挑选2个,和从正常人PBMC经Mtb耐热性抗原刺激增殖的T细胞中Vδ2-CDR3序列挑选2个,合成的4条多肽片段与噬菌体七肽库经4轮淘选后,得到特异性结合的噬菌体多肽序列47条,选择其中最富集序列和有交叉序列的9条,经GenBank BLAST比对分析,发现有4条7肽序列与某些Mtb抗原的序列高度重合。6从4条与Mtb抗原相关性的噬菌体多肽序列挑选2条合成7肽片段,用于体外培养实验发现,对某些正常人和TB患者个体的γδ T细胞有刺激增殖活性。结论:1. TB患者外周血γδ T细胞中Vδ2CDR3片段优势峰所占总峰比率比正常人的高,表明正常人γδ T细胞受体呈高斯分布,具有多克隆特点,而TB患者的显示寡克隆特点,提示TB患者的γδ T细胞经历了抗原特异性增殖。2TCRδ2基因CDR3片段中间的多变序列含有疏水性氨基酸残基,推测其与抗原肽结合的亲和力有关。TB患者大多优势取用DJ3片段,提示其与Mtb抗原的特异性识别可能有关。3.与健康人外周γδ T细胞经Mtb耐热抗原扩增后的Vδ2CDR3优势片段具有相同序列比较,TB患者的外周新鲜血γδ T细胞的Vδ2CDR3片段优势峰中序列呈多样化,提示不同TB患者的γδ T细胞的不同克隆参与对Mtb抗原的免疫应答。4本研究鉴定了4个TB患者特异性γδT细胞Vδ2-CDR3序列,经噬菌体七肽库筛选获得4条Mtb相关的抗原肽表位,并选择其中2条合成7肽片段,初步证实对正常人和TB患者的γδ T细胞有刺激增殖活性。(本文来源于《蚌埠医学院》期刊2012-05-01)

张惠媛[3](2005)在《γδT细胞抗原识别机制研究:热休克蛋白的直接识别以及HBV-TCR CDR3δ多肽结合特性和结合多肽的筛选》一文中研究指出γδT细胞兼具特异性和非特异性免疫应答双重特征,其在机体免疫应答中所处的进化地位和生物学意义与功能有待于进一步阐明。因此,揭示γδ抗原识别受体(TCR)抗原识别的规律,将有助于对上述理论问题进行澄清,并可为免疫学应用提供新的策略与手段。 本论文旨在研究γδT细胞对热休克蛋白(HSP)的识别机制和探讨乙型肝炎病毒感染患者TCR Vδ 2的抗原识别机理,以及以TCR CDR3δ为探针筛选和鉴定γδ TCR识别的表位多肽。 (一)人类γδ T细胞对细胞表面热休克蛋白(membrane HSPs)识别机制的研究 热休克蛋白在免疫应答中主要作用包括:1)与表位肽形成HSPs-peptide复合物,表达在细胞表面,参与抗原提呈过程;2)作为靶分子直接为免疫细胞所识别,诱导产生免疫应答。针对上述问题,本文首先重点研究了在γδT细胞识别HSP分子的过程中,HSP分子究竟是作为抗原提呈分子还是作为抗原这一基本问题,继而初步探讨了HSP分子和γδT细胞相互作用的生物学意义。为此,首先我们以EB病毒(EBV)转化B淋巴细胞(LCL细胞)作为细胞模型,探讨了细胞转化这一应激事件对细胞膜表面HSP分子表达水平的影响;其次应用siRNA干扰技术,分别敲除HSP60和HSP70分子,观察LCL细胞上述基因表达水平与γδT细胞对LCL细胞毒活性间的相关性;最后,利用体外增殖实验,探讨HSP分子是否对γδT细胞具有直接刺激作用。研究结果显示,在LCL细胞表面,HSP60和HSP70分子均可在转化应激的诱导下表达增高。HSP70分子表达下调后,γδT细胞对自体和异体来源的LCL细胞毒活性均受到抑制,与对照组相比具有显着统计学意义(P<0.05),而HSP60分子表达水平对γδT细胞杀伤活性的影响较小。[~3H]-TdR掺入实验证实了HSP72分子可以直接刺激γδT细胞发生增殖。上述结果不仅在理论上支持了γδT细胞通过直接识别HSP分子参与早期免疫应答,尤其在对肿瘤的免疫监视,同时也为以HSP70分子(尤其是HSP72分子)为(本文来源于《中国协和医科大学》期刊2005-07-01)

抗原多肽结合区论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

研究背景:许多研究已证实γδ T细胞在抗结核分枝杆菌(Mycobacteriumtuberculosis, Mtb)感染免疫中发挥重要作用。人γδ T细胞受体(TCRγδ)主要由Vγ9和Vδ2组成,在健康人外周血γδ T细胞中约80%为Vγ9δ2T细胞,已发现活动性结核病(TB)患者的外周Vγ9δ2T细胞数量和对Mtb抗原刺激的增殖活性均有明显降低。但是这类Vγ9δ2T细胞亚群在抗原识别以及克隆特征方面在TB患者和健康人之间有何不同,至今了解尚不完全。鉴于TCRγδ的γ或δ链V区的互补决定簇区3(CDR3)是识别抗原表位的关键位点,而目前对于TCRγδ所识别的Mtb抗原多肽表位也不完全清楚。因此从检测和分析TB患者γδ T细胞Vδ-CDR3基因谱型和序列特征,有助于理解γδ T细胞在抗原识别方面的克隆特征。另外根据TB患者的优势CDR3片段序列合成的肽片段,从噬菌体多肽展示库中筛选出Mtb相关性性的抗原表位。将有助于揭示γδ T细胞识别Mtb抗原表位的机制,为Mtb感染的诊断和防治提供新的方法。目的:检测和分析活动性肺TB患者外周血γδT细胞受体Vδ2链CDR3片段基因谱型和序列特征,应用Vδ2-CDR3优势片段序列合成肽在噬菌体多肽展示库中筛选Mtb抗原相关的多肽表位,并对合成的Mtb抗原多肽表位的激活人γδ T细胞活性进行初步鉴定。为阐明TB患者的T细胞免疫应答机制以及免疫诊断和治疗研究提供新的科学依据。方法:1.采集肺TB患者(n=27)和健康人(n=25)外周血分离PBMC提取RNA,用RT-PCR方法扩增TCRγδ的Vδ2基因CDR3片段,PCR产物通过基因扫描分析CDR3片段长度的多样性变化。2. Vδ2-CDR3的PCR产物纯化后连接PMD18-T载体重组质粒,转化及阳性筛选后用菌落PCR法对重组阳性质粒进行鉴定,并对阳性质粒PCR产物进行基因扫描分析确定其CDR3长度;3.对Vδ2-CDR3的PCR产物基因扫描优势峰对应的大部分重组质粒转化阳性克隆,以及部分非优势峰对应克隆的CDR3基因片段,测定DNA序列,并分析和比较其编码氨基酸的特征。4.从TB患者新鲜PBMC和正常人PBMC经Mtb耐热性抗原刺激增殖的T细胞扩增Vδ2-CDR3的最优势序列,合成多肽片段包被平板,加噬菌体7肽库温育后,先洗去未结合的噬菌体,然后洗脱并收获特异结合的噬菌体扩增。经3-4轮结合-淘选-扩增循环,富集特异性结合噬菌体,并经过DNA测序分析和ELISA验证阳性噬菌体,通过BLAST生物信息学分析和比对噬菌体展示多肽序列与Mtb抗原的相关性。5.从特异性富集噬菌体的多肽序列中寻找到的与Mtb相关的肽表位序列,合成7肽片段后作为抗原刺激正常人和TB患者的外周血PBMC,用流式细胞术检测γδ T细胞的增殖活性。结果:1对PBMC中TCRγδ的Vδ2-CDR3片段基因扫描结果显示:TB患者组(n=27)优势峰占总峰的比率(0.2755±0.0619)较正常人组(n=25)(0.1979±0.0346)高,TB患者组的长度变化范围为(25.11±5.52)较正常人为(19.87±3.52)高,差异均有统计学意义(p<0.0和p<0.0)。2TB患者TCRγδ的Vδ2-CDR3的片段数和最优势峰长度,与正常人比较无显着变化。3基因扫描分析显示CDR3转化阳性菌落PCR峰与CDR3的RT-PCR产物中的扫描峰有很好的对应关系;有意义的是最高频率菌落(占40%)的CDR3片段长度与PBMC的RT-PCR产物的基因扫描优势峰长度完全相同。4对CDR3转化的克隆(73个)的测序结果表明:TCR Vδ2–CDR3序列均由两端保守的侧翼序列和中间的多变序列组成;两端保守的侧翼序列由位于N端的“CACD”和位于C端的“KLIFGKG”组成,多变的中间序列97号位均含有疏水性氨基酸残基。该其中TB患者优势取用DJ3片段。每位TB患者有自己的优势序列,患者间偶发现有共有序列。5从TB患者新鲜PBMC中Vδ2-CDR3的优势序列挑选2个,和从正常人PBMC经Mtb耐热性抗原刺激增殖的T细胞中Vδ2-CDR3序列挑选2个,合成的4条多肽片段与噬菌体七肽库经4轮淘选后,得到特异性结合的噬菌体多肽序列47条,选择其中最富集序列和有交叉序列的9条,经GenBank BLAST比对分析,发现有4条7肽序列与某些Mtb抗原的序列高度重合。6从4条与Mtb抗原相关性的噬菌体多肽序列挑选2条合成7肽片段,用于体外培养实验发现,对某些正常人和TB患者个体的γδ T细胞有刺激增殖活性。结论:1. TB患者外周血γδ T细胞中Vδ2CDR3片段优势峰所占总峰比率比正常人的高,表明正常人γδ T细胞受体呈高斯分布,具有多克隆特点,而TB患者的显示寡克隆特点,提示TB患者的γδ T细胞经历了抗原特异性增殖。2TCRδ2基因CDR3片段中间的多变序列含有疏水性氨基酸残基,推测其与抗原肽结合的亲和力有关。TB患者大多优势取用DJ3片段,提示其与Mtb抗原的特异性识别可能有关。3.与健康人外周γδ T细胞经Mtb耐热抗原扩增后的Vδ2CDR3优势片段具有相同序列比较,TB患者的外周新鲜血γδ T细胞的Vδ2CDR3片段优势峰中序列呈多样化,提示不同TB患者的γδ T细胞的不同克隆参与对Mtb抗原的免疫应答。4本研究鉴定了4个TB患者特异性γδT细胞Vδ2-CDR3序列,经噬菌体七肽库筛选获得4条Mtb相关的抗原肽表位,并选择其中2条合成7肽片段,初步证实对正常人和TB患者的γδ T细胞有刺激增殖活性。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

抗原多肽结合区论文参考文献

[1].王瑞,李莉萍,黄婷,梁万文,甘西.重组罗非鱼Hsp70蛋白ATPase和抗原多肽结合活性研究[J].水生生物学报.2013

[2].丁艳.肺结核患者外周γδT细胞Vδ2-CDR3序列特征及其合成多肽结合抗原肽的筛选和鉴定[D].蚌埠医学院.2012

[3].张惠媛.γδT细胞抗原识别机制研究:热休克蛋白的直接识别以及HBV-TCRCDR3δ多肽结合特性和结合多肽的筛选[D].中国协和医科大学.2005

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