应用于天然产物研究与开发的代谢组学数据库

论文摘要

代谢组学在对生物体系的小分子代谢物进行定性和定量研究中产生了大量的数据,成为天然产物研究和开发的重要工具。一系列公开、方便且注释良好的代谢组学数据库和全功能软件的开发促进了天然产物大数据的集成、处理和解释,这不仅有利于数据的存储、管理和分析,还可作为信息共享联动的平台。基于质谱的代谢组学数据库的建立对于天然产物已知成分筛选、未知成分鉴定起着十分重要的作用。对国内外常用的代谢组学数据库及其特征进行综述,强调它们的内容、功能和应用,为数据库的选择提供理论依据,并展望代谢组学数据库的开发趋势。

论文目录

• 1 基于液相色谱–质谱联用的代谢组学数据库
•   1.1 全球天然产物社会分子网络
•   1.2 Mass Bank数据库
•   1.3 METLIN数据库
•   1.4 人类代谢组学数据库
•   1.5 日本理化学研究所串联质谱数据库
•   1.6 植物代谢物注释工具箱
•   1.7 质谱云数据库
• 2 基于气相色谱–质谱联用的代谢组学数据库
•   2.1 戈尔姆代谢组学数据库
•   2.2 菲恩质谱图书馆
•   2.3 麦迪逊代谢联盟数据库
•   2.4 美国国家标准与技术研究院数据库
• 3 基于离子淌度质谱的代谢组学数据库
•   3.1 代谢物碰撞横截面积预测数据库
•   3.2 计算机模拟化学图书馆
• 4 化学综合数据库
• 5 代谢组学全功能软件
• 6 总结与展望

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 张柳,王丽瑶,张凯雪,魏冠华,杨志刚

关键词: 天然产物,代谢组学,质谱,数据库,全功能软件

来源: 化学分析计量 2019年05期

年度: 2019

分类: 工程科技Ⅰ辑,医药卫生科技

专业: 化学,中药学

单位: 兰州大学药学院

基金: 国家重点研发计划政府间国际科技创新合作重点专项(2016YFE0129000),甘肃省中医药管理局科研课题(GZK–2015–21),兰州大学中央高校基本科研业务费专项资金(lzujbky–2017–k26)

分类号: O657;R28

页码: 128-134

总页数: 7

文件大小: 1103K

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