植物高效群体转录组测序技术研究

植物高效群体转录组测序技术研究

论文摘要

基因表达作为一种中间表型,能够将基因组中的性状控制变异和作物的重要农艺性状关联起来,为阐明遗传机理并应用到作物改良当中提供了新的契机。然而,由于目前基因表达谱检测方法的效率不高,植物转录组学在精准遗传定位的巨大潜力受到了限制。为充分利用植物转录组测序辅助精准遗传定位,我们研发了一种多通路3’RNA-seq建库方法,极大地提高了基因表达谱检测效率。应用该方法,我们对小麦苗期不同组织进行了表达谱检测,结果表明该方法具有成本低、时间短、重复性好以及准确性高的特点。对六倍体小麦的11万个基因进行表达谱检测,只需要500万reads,技术重复的相关系数就可以达到0.95。我们的方法在保证稳定性的同时,实现了高通量低成本的群体转录组信息捕获,为植物遗传解析和育种提供了有力的工具。

论文目录

文章来源

类型: 国内会议

作者: 徐俊,王静,杨晓寒,鲁非

关键词: 转录组,小麦,群体

来源: 第十届全国小麦基因组学及分子育种大会 2019-08-11

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学,生物学

单位: 中国科学院种子创新研究院遗传与发育生物学研究所植物细胞与染色体工程国家重点实验室中国科学院大学中科院-英国约翰.英纳斯中心植物和微生物科学联合研究中心

分类号: Q943.2

DOI: 10.26914/c.cnkihy.2019.021118

页码: 237

总页数: 1

文件大小: 34k

下载量: 37

相关论文文献

  • [1].基因表达谱技术分析棒曲霉毒素肾细胞毒性的机制[J]. 现代食品科技 2017(06)
  • [2].基于高通量测序的数字基因表达谱技术研究进展[J]. 北方园艺 2015(10)
  • [3].基因表达谱技术:贵亦需有道[J]. 医学争鸣 2010(04)
  • [4].我国发现Ⅰ型糖尿病的多基因表达谱,有助于该病的预测[J]. 生物学教学 2014(09)
  • [5].基于加权极限学习机的肿瘤基因表达谱数据分类[J]. 东北大学学报(自然科学版) 2017(06)
  • [6].奥美拉唑对人脐静脉内皮细胞全基因表达谱的影响及机制分析[J]. 南方医科大学学报 2012(04)
  • [7].脂多糖活化巨噬细胞的数字基因表达谱分析[J]. 中国药理学与毒理学杂志 2013(06)
  • [8].肾阴虚证和肾阳虚证基因表达谱的比较研究[J]. 山西医科大学学报 2012(09)
  • [9].口腔鳞癌细胞外泌体分离鉴定及基因表达谱研究[J]. 中华肿瘤防治杂志 2018(19)
  • [10].原发性骨质疏松症肾阳虚证骨组织全基因表达谱研究[J]. 中国骨质疏松杂志 2017(07)
  • [11].结肠癌基因表达谱降噪算法研究[J]. 医学理论与实践 2015(14)
  • [12].黄芩素对白念珠菌基因表达谱的影响[J]. 第二军医大学学报 2010(07)
  • [13].气滞血瘀证大鼠舌部基因表达谱变化初探[J]. 中国比较医学杂志 2017(09)
  • [14].中医药对类风湿关节炎细胞凋亡及基因表达谱的影响[J]. 中华中医药杂志 2010(04)
  • [15].重金属胁迫下白骨壤数字基因表达谱分析[J]. 林业科学研究 2017(02)
  • [16].高温胁迫下坛紫菜的数字基因表达谱研究[J]. 海洋学报(中文版) 2014(06)
  • [17].基于流形学习的基因表达谱数据可视化[J]. 生物信息学 2009(01)
  • [18].鼻息肉基因芯片检测及基因表达谱的研究[J]. 临床耳鼻咽喉头颈外科杂志 2008(11)
  • [19].转化生长因子β对人肾小管上皮细胞全基因表达谱的影响及其生物信息学分析[J]. 临床肾脏病杂志 2019(06)
  • [20].溃疡性结肠炎患者结肠黏膜基因表达谱生物信息学分析[J]. 解放军医药杂志 2019(11)
  • [21].基因表达谱微阵列网络数据库在肿瘤研究中的应用[J]. 中国生物化学与分子生物学报 2016(03)
  • [22].识别乳腺癌固有成像表型:与基因表达谱相关的初步研究[J]. 国际医学放射学杂志 2014(05)
  • [23].2型糖尿病的基因表达谱分析[J]. 中国实用内科杂志 2012(07)
  • [24].正常-脑瘫双生子基因表达谱差异研究[J]. 辽宁中医杂志 2009(11)
  • [25].脂多糖诱导实验性急性水肿性胰腺炎演变为急性坏死性胰腺炎的基因表达谱变化[J]. 胃肠病学 2008(06)
  • [26].基因表达谱技术从消化道肿瘤基础研究到临床转化[J]. 世界华人消化杂志 2018(34)
  • [27].变应性鼻炎发病相关基因表达谱的生物信息学分析及作为药物筛选新方法的探索[J]. 临床耳鼻咽喉头颈外科杂志 2018(19)
  • [28].干旱胁迫下丹参数字基因表达谱分析[J]. 基因组学与应用生物学 2018(10)
  • [29].盐胁迫下旱地棉叶片数字化基因表达谱分析[J]. 江苏农业学报 2016(03)
  • [30].依硫磷酸调控人类基因表达谱的预测及生物信息学分析[J]. 中国实验血液学杂志 2011(03)

标签:;  ;  ;  

植物高效群体转录组测序技术研究
下载Doc文档

猜你喜欢