木薯果胶甲基酯酶抑制因子MePMEI1的生物信息学分析

论文摘要

为探讨木薯MePMEI1的分子结构特征。通过PCR扩增和测序技术及生物信息学分析工具对木薯MePMEI1基因进行克隆、测序及相关生物信息学分析。结果表明木薯MePMEI1基因编码区全长609 bp,编码202个氨基酸残基;MePMEI1基因编码蛋白分子量21.78 k D,理论等电点(pI)约为5.51;生物信息学预测发现,木薯MePMEI1蛋白是稳定的亲水蛋白;具有跨膜区为分泌蛋白;含有1个PMEI结构域,1个糖基化位点,31个磷酸化位点;二、三级结构以α螺旋和无规则卷曲为主。该蛋白的生物功能可能与细胞被膜、酶和生长因子等相关。木薯MePMEI1基因的生物信息学分析为进一步研究其遗传特性和生理生化机制提供了理论依据。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 木薯MePMEI1基因的克隆与序列分析
•   1.2 MePMEI1理化性质分析
•   1.3 MePMEI1蛋白的亲水性/疏水性预测和分析
•   1.4 MePMEI1蛋白质跨膜结构的预测分析
•   1.5 MePMEI1蛋白信号肽的预测分析
•   1.6 MePMEI1蛋白质的磷酸化和糖基化位点分析
•   1.7 蛋白的二级和三级结构预测
•   1.8 MePMEI1蛋白质功能与结构功能域预测
•   1.9 MePMEI1蛋白的亚细胞定位分析
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 实验材料
•   3.2 MePMEI1基因的克隆
•   3.3 MePMEI1蛋白的生物信息学分析
• 作者贡献

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 周杨骄,李瑞梅,袁帅,仇婷婷,姚远,刘姣,符少萍,段瑞军,胡新文,郭建春

关键词: 木薯,果胶甲基酯酶抑制因子,生物信息学

来源: 基因组学与应用生物学 2019年03期

年度: 2019

分类: 基础科学,医药卫生科技,农业科技

专业: 生物学,农作物

单位: 海南大学热带农林学院,中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室

基金: 海南省重点研发计划(ZDYF2017073),国家自然科学资金(No.31601359,No.31600196,No.31671767),现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-11-HNGJC),中国热带农业科学院基本科研业务费专项资金(1630052016004,1630052-015014)共同资助

分类号: S533;Q811.4

DOI: 10.13417/j.gab.038.001186

页码: 1186-1192

总页数: 7

文件大小: 341K

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