青藏高原不同生境土壤细菌群落结构特征及其与环境的关系

青藏高原不同生境土壤细菌群落结构特征及其与环境的关系

论文摘要

为了解土壤微生物在青藏高原的分布状况及环境依赖特点,对青藏高原5种不同类型的土壤微生物群落结构、组成及其与环境关系进行了研究。通过高通量测序技术研究青藏高原不同生境土壤细菌的组成和多样性,共获得1 463 157条16S rRNA基因序列。各样品中可操作分类单元(Operational taxonomic units,OTUs)在4 344~5 764之间。土壤样品中细菌以变形菌门(35.5%)、放线菌门(20.4%)、酸杆菌门(12.5%)、拟杆菌门(7.3%)、绿弯菌门(6.1%)和厚壁菌门(5.3%)为主,其中变形菌门最为丰富。在变形菌门中,α-变形菌纲是第一大纲,占有45.9%的OTUs,其后是γ-变形菌纲和β-变形菌纲。Person相关性分析和RDA分析表明,土壤含水量、有机碳含量与钾含量对细菌群落分布起主要作用。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 研究区域概况
  •   1.2 样地设置与数据采集
  •   1.3 土壤主要理化性质的测定
  •   1.4 土壤DNA基因组提取和测序
  •   1.5 生物信息分析与数据处理
  • 2 结果与分析
  •   2.1 多样性指数分析
  •   2.2 细菌群落结构分析
  •   2.3 细菌群落多样性与环境因子之间的关系
  •   2.4 细菌群落与环境因子的关系
  •     2.4.1 环境因子的RDA排序
  •     2.4.2 细菌群落的RDA排序
  • 3 结论与讨论
  •   3.1 土壤细菌群落组成
  •   3.2 细菌群落结构与环境因子
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 程亮,王信,郭青云

    关键词: 细菌群落,高通量测序,微生物环境关系,青藏高原

    来源: 干旱地区农业研究 2019年01期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,农业基础科学,农艺学

    单位: 青海大学农林科学院植物保护研究所,青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室,青海省农业有害生物综合治理重点实验室,青海大学农林科学院土壤肥料研究所

    基金: 青海省科技计划项目基础研究计划(2015-ZJ-705),青海大学中青年科研基金项目(2015-QNY-2)

    分类号: S154.3

    页码: 18-26

    总页数: 9

    文件大小: 429K

    下载量: 306

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