环状RNA在肺腺癌中的差异表达分析

论文摘要

目的:分析肺腺癌（LAC）组织中环状RNA（circRNA）的差异表达,探讨circRNA参与LAC发展的机制。方法:通过基因芯片筛选6例LAC患者中circRNA的差异表达谱。采用微小RNA（miRNA）靶预测软件预测circRNA和miRNA相互作用的结合位点,再分别预测最显著高表达及低表达的两条circRNA分子下游相关的靶基因,并分析和探索其中涉及的生物学通路。结果:共有19条circRNA在癌组织标本内差异表达至3倍以上,其中最显著差异上调的hsacircRNA100323及下调的hsacircRNA051620具有多个miRNA结合位点,它们可能通过各种生物学过程及通路参与LAC的发生与发展。结论:LAC患者中circRNA表达谱发生了显著变化,最显著高表达和低表达的hsacircRNA100323及hsacircRNA051620可能通过miRNA"海绵"吸附作用在LAC的发生和发展中发挥重要作用。

论文目录

• 1 资料与方法
•   1.1 一般资料
•   1.2 方法
•     1.2.1 标本RNA的提取和circRNA芯片检测
•     1.2.2 CircRNA相关miRNA的预测
•     1.2.3 CircRNA相关miRNA调控靶基因的预测
•     1.2.4 CircRNA相关miRNA调控靶基因的生物信息学分析
•   1.3 统计学处理
• 2 结 果
•   2.1 差异表达的circRNA及与其相关的miRNA和靶基因
•   2.2 CircRNA相关miRNA调控靶基因的生物信息分析
• 3 讨 论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 华欣,孙岳,朱晓莉

关键词: 肺腺癌,环状,差异表达,基因芯片,生物学通路

来源: 东南大学学报(医学版) 2019年06期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技

专业: 肿瘤学

单位: 东南大学医学院,东南大学附属中大医院呼吸科

基金: 江苏省研究生实践创新计划项目(SJCX18_0064)

分类号: R734.2

页码: 1019-1023

总页数: 5

文件大小: 1130K

下载量: 117