禽致病性大肠杆菌双组分系统phoP/Q对鞭毛Ⅲ型分泌系统基因的调控预测

论文摘要

本研究旨在探究禽致病性大肠杆菌(APEC)中双组分系统phoP/Q与鞭毛Ⅲ型分泌系统(鞭毛T3SS)蛋白之间的联系。运用软件进行功能分析,预测phoP/Q与鞭毛T3SS的关系,利用基因芯片技术对APEC野生株和ΔphoP/Q缺失突变株进行转录组的差异性比较,筛选鞭毛T3SS基座中变化较大基因,并用荧光定量PCR检测基因表达变化量。结果显示:经STRING预测发现phoP/Q可能通过调控鞭毛T3SS基因座附近的双组分系统来间接调控鞭毛T3SS。基因芯片筛选与荧光定量PCR检测发现phoP/Q缺失能使鞭毛T3SS核心组件的大部分基因表达差异显著,同时也影响了双组分中motA、motB与cheY的表达。本研究对phoP/Q双组分系统与鞭毛T3SS的关系进行了预测与探索,为进一步研究揭示细菌的活动与致病机制提供了新的切入点与研究方向。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材料与试剂
•   1.2 目的基因检测
•   1.3 基因芯片
•     1.3.1 样品制备
•     1.3.2 芯片杂交
•     1.3.3 芯片扫描与结果处理
•   1.4 通路预测
•   1.5 荧光定量PCR
• 2 结 果
•   2.1 PCR检测及基因分布情况
•   2.2 转录差异基因的筛选
•   2.3 通路预测
•   2.4 qRT-PCR验证
• 3 讨 论
• 4 结 论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 邓志文,王泽平,李倩文,尹磊,涂健,宋祥军,祁克宗

关键词: 禽致病性大肠杆菌,鞭毛,基因芯片

来源: 畜牧兽医学报 2019年04期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 安徽农业大学兽医病理生物学与疫病防控安徽省重点实验室

基金: 国家自然科学基金(31772707,31802161)

分类号: S852.61

页码: 821-829

总页数: 9

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