导读:本文包含了核苷酸序列分析论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因,核苷酸,序列,相似性,基因芯片,家兔,多态性。
核苷酸序列分析论文文献综述
陈名君,林俨,黄勃[1]（2019）在《根虫瘟霉和相关种的分类地位研究及其ITS核苷酸序列分析》一文中研究指出根虫瘟霉是最常见的一种虫霉,寄主广泛,世界广布。目前有学者认为该种是个复寄主的根虫瘟霉及其近缘类群总计19个菌株,进行3个靶位点(ITèU合种。S、LSU D本研究对世界不同地区和不同rDNA、RPB2)的分子系统发育学分析。结果显示,根虫瘟霉ITS长度较为保守性,介于1 321–1 324bp之间,而所研究的虫霉亚门的其他类群的长度范围较大,为556–1654bp。本研究确认根虫瘟霉是单系种,同时西虫瘟霉、矛孢虫瘟霉和英吉利虫瘟霉具有明确种的分类地位。鬼笔状虫瘟霉种应该被视为西虫瘟霉的异名。(本文来源于《菌物学报》期刊2019年10期）
郝志云,王继卿,胡江,刘秀,李少斌[2]（2018）在《绵羊STAT5a基因的组织表达及核苷酸序列变异分析》一文中研究指出信号传导与转录激活因子5a(signal transducer and activators of transcription 5a,STAT5a)作为产奶性状的候选基因,在调控动物乳腺发育中具有重要的作用。本研究利用实时荧光定量PCR(quantitative Real-time PCR,q RT-PCR)技术检测藏绵羊(Ovis aries)和小尾寒羊STAT5a基因在心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、小脑和乳腺7个不同脏器组织中的表达量、研究绵羊品种和组织间差异表达;利用多聚酶链式反应-单链构象多态(polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphsim,PCRSSCP)技术和测序法分析藏绵羊、湖羊和多浪羊STAT5a基因在P1和P2两个扩增区域内的核苷酸序列变异及群体遗传特征。结果表明,STAT5a基因在绵羊7个组织中均有表达,并表现出明显的品种差异性和组织差异性,在藏绵羊和小尾寒羊中,STAT5a基因在乳腺组织中的表达量显着高于其他6个组织(P<0.01),而2个品种之间,小尾寒羊乳腺组织的表达量显着高于藏绵羊(P<0.05),但在肝脏、肺脏、肾脏和小脑的表达量显着低于藏绵羊(P<0.05);在P1引物的扩增区域中,各绵羊群体中均检测到c.2150-154C>T和c.2150-50T>C 2个SNPs和对应的等位基因A、B,其中等位基因B为优势等位基因,基因型BB为优势基因型,藏绵羊多态信息含量为0.25<PIC<0.5,属中度多态,湖羊和多浪羊PIC<0.25,属低度多态。3个绵羊群体的χ~2值均未达到显着水平(P>0.05),处于Hardy-Weinberg平衡状态。在P2引物的扩增区域中,未检测到多态性。本研究结果可以丰富绵羊基因组学内容,为研究乳腺性状形成的分子机制提供基础性资料。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2018年01期）
朱建勋,王继卿,胡江,刘秀,李少斌[3]（2016）在《五个绵羊群体KAP11-1基因核苷酸序列变异分析》一文中研究指出为了分析绵羊KAP11-1基因的核苷酸序列变异,采用PCR-SSCP方法和DNA测序技术检测了欧拉羊、甘肃高山细毛羊、滩羊、湖羊和青海细毛羊5个群体(749只个体)KAP11-1基因的单核苷酸多态性,同时分析了等位基因频率、遗传杂合度、有效等位基因数和多态信息含量等群体遗传特征。结果表明,5个绵羊群体的KAP11-1基因中共检测到c.93C/T、c.240G/A、c.285C/G/A和c.331A/G 4个单核苷酸多态位点,且c.331A/G为非同义突变。等位基因A在5个群体中出现的频率最高(87.70%),为优势等位基因,其次为等位基因B(基因频率为11.03%),等位基因C和D的频率最低(分别为0.53%和0.74%)。群体遗传学分析结果表明,滩羊KAP11-1基因的遗传杂合度、有效等位基因数和多态信息含量均高于其余4个群体。KAP11-1基因作为羊毛经济性状的主要候选基因之一,其核苷酸序列的变异导致KAP11-1中相应氨基酸的改变,最终可能会影响羊毛纤维的结构和羊毛主要经济性状。(本文来源于《华北农学报》期刊2016年05期）
冶贵生,马玉花,张爽,梅成和,张晓芬[4]（2015）在《A型产气荚膜梭菌tetB(P)耐药基因核苷酸序列与蛋白结构分析》一文中研究指出为了对产气荚膜梭菌tetB(P)耐药基因进行分析,通过生物软件设计引物,扩增A型产气荚膜梭菌tetB(P)耐药基因,测序后对tetB(P)基因核苷酸序列与蛋白结构进行分析.结果表明:分离株tetB(P)基因长度为1 959bp,编码652个氨基酸.与参考菌株CW92、EHE-NE18的核苷酸序列同源性依次为99.7%、99.9%,氨基酸序列同源性依次为99.4%、99.8%.分离株tetB(P)蛋白亲水性氨基酸较多,无跨膜区,含有4个N-糖基化位点,1个cAMP和cGMP依赖性蛋白激酶磷酸化位点,9个蛋白激酶C磷酸化位点,12个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,7个N-豆寇酰化位点,1个ATP/GTP结合位点基序,1个翻译型鸟苷酸结合域,叁级结构主要是由α-螺旋、β折叠和无规则卷曲形成.(本文来源于《甘肃农业大学学报》期刊2015年04期）
马秋月[5]（2014）在《枣基因组微卫星及核苷酸序列变化特征分析》一文中研究指出枣（Ziziphus jujuba Mill.）是鼠李科(Rhamnaceae)的树种之一，主要分布在亚洲和美洲的热带和亚热带，是重要的经济树种。与其他经济树种相比，其基因组数据比较匮乏，本研究利用454高通量测序技术对枣基因组进行了部分测序。经序列拼接，共获得总长约为8.4Mb的基因组序列，从中找到15036个微卫星重复序列。在这些重复序列中，六碱基重复类型的重复数目最丰富，共6033个，占重复序列总数的40.1%；其次是复合型碱基2707个和单碱基2575个，分别占重复序列总数的18.0%和17.1%。另外，二碱基重复1118个，叁碱基1050个，四碱基1218个，五碱基335个，分别占重复序列的7.5%、7.0%、8.1%、2.2%。通过分析发现虽然六碱基重复类型所占比例最多，但二碱基微卫星重复单元的重复次数变化显着高于其它重复类型。在单碱基重复和二碱基重复这两种类型中，最主要的重复单元分别是A/T以及AT/TA；叁碱基、四碱基、五碱基、六碱基重复类型中，(AAN)n、(AAAN)n、(AAAAN)n和(AAAAAN)n为对应的优势重复单元，这些优势重复单元中富含A和T碱基。分析还发现，枣基因组微卫星长度变化的多样性与重复单元长度呈负相关(二碱基重复类型除外)，这意味着枣基因组中重复单元较短的微卫星变异速率较快，而重复单元较长的微卫星变异速率较慢。对枣基因组微卫星侧翼序列分析发现，左侧序列与右侧序列GC含量相差不大；设计的引物序列中，有86%的引物可以特异扩增出含有SSR序列的位点。通过序列比对方法对枣树的核苷酸序列变化进行分析研究，发现有17160个SNP和478个InDel，在SNP中转换数量是颠换的叁倍多，在转换中C/T和G/A的数量接近，而在颠换类型中C/G的数量要比A/C、 A/T和G/T要少的多；在InDel中，单碱基变化类型最多，约占64.4%，而且我们还发现随着InDel长度的不断增加，其数量逐渐减小。本研究的结果将为枣后期枣树的遗传研究提供了丰富的序列信息和标记资源。(本文来源于《南京林业大学》期刊2014-06-01）
杨发龙,邝良德,谢晓红,雷岷,李丛艳[6]（2013）在《家兔Nramp1基因第9外显子单核苷酸序列多态性分析》一文中研究指出实验利用PCR-SSCP方法对4个不同品种(系)家兔Nramp1基因第9外显子的多态性进行研究。结果表明:该区域存在1个突变位点,共出现3种基因型,分别为AA、BB和AB,不同品种(系)间的基因型分布存在显着差异,其中齐卡巨型白兔和齐兴肉兔中AA型为优势基因型,A为优势等位基因;而加利福尼亚兔和比利时兔中BB型为优势基因型,B为优势等位基因。χ2适合性检验结果表明,该突变位点在齐卡巨型白兔和齐兴肉兔群体中没有达到哈代-温伯格平衡(P<0.05),而在加利福尼亚兔和比利时兔群体中达到哈代-温伯格平衡(P>0.05)。(本文来源于《中国畜牧杂志》期刊2013年11期）
刘炜炜,许文博,刘升学,黄家风[7]（2012）在《蚕豆萎蔫病毒2的分子鉴定及RNA1组分5′末端核苷酸序列分析》一文中研究指出用蚕豆病毒属(Fabavirus)的兼并引物Fab5′R1F和Fab5R′1R对自然感病的4株加工番茄、1株辣椒和2株一串红病株进行RT-PCR,将扩增到的长约400bp的片段进行克隆和测序。结果发现:来自7个病株的9个病毒分离物均为蚕豆萎蔫病毒2(BBWV-2)基因组RNA1组分5′末端的353～392个核苷酸;同源性比较表明,9个序列之间的同源性为90.4%～99.2%,与已报道的BBWV2的同源性为89.5%～95.9%。序列比对发现,BBWV2基因组RNA1组分5′末端非编码区包含了由11个碱基(AAACAGCUUUC)组成的重复序列,而分别来自加工番茄分离物XJ14-1b和一串红的分离物S12在重复序列区段内比其它所有分离物缺少了包括2个重复序列在内的36个碱基。(本文来源于《石河子大学学报(自然科学版)》期刊2012年06期）
金圣华,刘金岭[8]（2012）在《基于核苷酸序列的探针水平数据分析》一文中研究指出微阵列实验是一个复杂的多步骤的实验过程,不确定性存在于实验的每一个步骤中,导致最后得到的实验结果中包含了一些数据噪声。为了从这些含有噪声的数据中得到更多有意义的生物信息,很多算法相继被提出来计算基因表达值。目前流行的mmgMOS模型提高了芯片数据分析的准确性,但是该模型的主要缺点是其参数值φ在整个数据集上是唯一不变的,单一的值不能代表不同探针的真实信号。本文对mmgMOS模型中的参数值φ进行改进,从而进一步提高后续寻找差异基因的准确率。(本文来源于《计算机工程与科学》期刊2012年11期）
李鑫,丁镌,侯玲,刘杰[9]（2012）在《新等位基因HLA-B~* 56:21的核苷酸序列分析》一文中研究指出目的确认HLA新等位基因HLA-B*56∶21并分析其有异常反应格局的核苷酸序列。方法标本DNA抽提采用美国Tiangen试剂盒,采用聚合酶链反应序列-特异寡核苷酸探针杂交技术(PCR-SSOP)进行HLA分型,发现1个与HLA-B*56相关的异常基因,使用DNA测序分型技术(PCR-SBT)直接测定其基因序列,并分析其与最接近的HLA-B*56∶05∶02和HLA-B*56∶07基因序列的差异。结果新基因与所有已知的HLA-B等位基因序列均不相同,与HLA-B*56∶05∶02基因序列相比在第2外显子有6个碱基发生替代,导致5个氨基酸发生改变;与HLA-B*56∶07相比,在第2外显子序列仅有2个碱基被替代,第3外显子序列有6个碱基被替代,也导致5个氨基酸发生改变。结论发现1个新的HLA-B等位基因,现已被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*56∶21,新等位基因HLA-B*56∶21与HLA-B*56∶05∶02、HLA-B*56∶07均有很高相似性。(本文来源于《中国输血协会第六届输血大会论文专辑（报告篇）》期刊2012-11-07）
李鑫,丁镌,侯玲,刘杰[10]（2012）在《新等位基因HLA-B~* 56:21的核苷酸序列分析》一文中研究指出目的确认HLA新等位基因HLA-B*56∶21并分析其有异常反应格局的核苷酸序列。方法标本DNA抽提采用美国Tiangen试剂盒,采用聚合酶链反应序列-特异寡核苷酸探针杂交技术(PCR-SSOP)进行HLA分型,发现1个与HLA-B*56相关的异常基因,使用DNA测序分型技术(PCR-SBT)直接测定其基因序列,并分析其与最接近的HLA-B*56∶05∶02和HLA-B*56∶07基因序列的差异。结果新基因与所有已知的HLA-B等位基因序列均不相同,与HLA-B*56∶05∶02基因序列相比在第2外显子有6个碱基发生替代,导致5个氨基酸发生改变;与HLA-B*56∶07相比,在第2外显子序列仅有2个碱基被替代,第3外显子序列有6个碱基被替代,也导致5个氨基酸发生改变。结论发现1个新的HLA-B等位基因,现已被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*56∶21,新等位基因HLA-B*56∶21与HLA-B*56∶05∶02、HLA-B*56∶07均有很高相似性。(本文来源于《中国输血杂志》期刊2012年10期）
核苷酸序列分析论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
信号传导与转录激活因子5a(signal transducer and activators of transcription 5a,STAT5a)作为产奶性状的候选基因,在调控动物乳腺发育中具有重要的作用。本研究利用实时荧光定量PCR(quantitative Real-time PCR,q RT-PCR)技术检测藏绵羊(Ovis aries)和小尾寒羊STAT5a基因在心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、小脑和乳腺7个不同脏器组织中的表达量、研究绵羊品种和组织间差异表达;利用多聚酶链式反应-单链构象多态(polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphsim,PCRSSCP)技术和测序法分析藏绵羊、湖羊和多浪羊STAT5a基因在P1和P2两个扩增区域内的核苷酸序列变异及群体遗传特征。结果表明,STAT5a基因在绵羊7个组织中均有表达,并表现出明显的品种差异性和组织差异性,在藏绵羊和小尾寒羊中,STAT5a基因在乳腺组织中的表达量显着高于其他6个组织(P<0.01),而2个品种之间,小尾寒羊乳腺组织的表达量显着高于藏绵羊(P<0.05),但在肝脏、肺脏、肾脏和小脑的表达量显着低于藏绵羊(P<0.05);在P1引物的扩增区域中,各绵羊群体中均检测到c.2150-154C>T和c.2150-50T>C 2个SNPs和对应的等位基因A、B,其中等位基因B为优势等位基因,基因型BB为优势基因型,藏绵羊多态信息含量为0.25<PIC<0.5,属中度多态,湖羊和多浪羊PIC<0.25,属低度多态。3个绵羊群体的χ~2值均未达到显着水平(P>0.05),处于Hardy-Weinberg平衡状态。在P2引物的扩增区域中,未检测到多态性。本研究结果可以丰富绵羊基因组学内容,为研究乳腺性状形成的分子机制提供基础性资料。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
核苷酸序列分析论文参考文献
[1].陈名君,林俨,黄勃.根虫瘟霉和相关种的分类地位研究及其ITS核苷酸序列分析[J].菌物学报.2019
[2].郝志云,王继卿,胡江,刘秀,李少斌.绵羊STAT5a基因的组织表达及核苷酸序列变异分析[J].农业生物技术学报.2018
[3].朱建勋,王继卿,胡江,刘秀,李少斌.五个绵羊群体KAP11-1基因核苷酸序列变异分析[J].华北农学报.2016
[4].冶贵生,马玉花,张爽,梅成和,张晓芬.A型产气荚膜梭菌tetB(P)耐药基因核苷酸序列与蛋白结构分析[J].甘肃农业大学学报.2015
[5].马秋月.枣基因组微卫星及核苷酸序列变化特征分析[D].南京林业大学.2014
[6].杨发龙,邝良德,谢晓红,雷岷,李丛艳.家兔Nramp1基因第9外显子单核苷酸序列多态性分析[J].中国畜牧杂志.2013
[7].刘炜炜,许文博,刘升学,黄家风.蚕豆萎蔫病毒2的分子鉴定及RNA1组分5′末端核苷酸序列分析[J].石河子大学学报(自然科学版).2012
[8].金圣华,刘金岭.基于核苷酸序列的探针水平数据分析[J].计算机工程与科学.2012
[9].李鑫,丁镌,侯玲,刘杰.新等位基因HLA-B~*56:21的核苷酸序列分析[C].中国输血协会第六届输血大会论文专辑（报告篇）.2012
[10].李鑫,丁镌,侯玲,刘杰.新等位基因HLA-B~*56:21的核苷酸序列分析[J].中国输血杂志.2012
论文知识图
