基于COⅠ基因分析7个罗非鱼群体的遗传变异

基于COⅠ基因分析7个罗非鱼群体的遗传变异

论文摘要

为了研究罗非鱼群体的遗传多样性及其系统进化关系,以尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)、奥利亚罗非鱼(O.aureus)、莫桑比克罗非鱼(O.mossambicus)、吉富罗非鱼(GIFT)和3种红罗非鱼(中国台湾红罗非鱼、马来西亚红罗非鱼、以色列红罗非鱼)7个群体为材料,对其线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)的序列进行PCR扩增和序列比对,分析7个罗非鱼群体的遗传变异情况。在324个样品中检测出180个多态性位点和98个单倍型,平均单倍型多样性为0.944,核苷酸多样性为0.036。中性检验Tajima’s D值显示GIFT、莫桑比克罗非鱼和奥利亚罗非鱼群体在经历瓶颈效应和/或纯化选择后种群规模扩大。7个罗非鱼群体间的遗传距离为0.000~0.071,种群遗传分化指数(Fst)值为0.016~0.994。AMOVA分析显示,大多数遗传变异来自群体间(70.78%)。研究还发现,本实验中的奥利亚罗非鱼遗传多样性最低,其余6个群体的遗传多样性较丰富。利用COⅠ基因对7个罗非鱼群体的遗传结构进行分析,丰富了罗非鱼种群特别是红罗非鱼的遗传背景数据,对其种质资源利用具有一定的指导意义。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 样本的来源和采集
  •   1.2 方法
  •     1.2.1 DNA的提取
  •     1.2.2 COⅠ基因片段的扩增和测序
  •     1.2.3 数据分析
  • 2 结果
  •   2.1 7个群体罗非鱼COⅠ序列的变异位点与单倍型分布
  •   2.2 罗非鱼群体遗传多样性
  •   2.3 遗传距离和遗传分化
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 姜冰洁,傅建军,朱文彬,王兰梅,方敏,董在杰

    关键词: 罗非鱼,基因,群体,遗传多样性

    来源: 上海海洋大学学报 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 农业科技

    专业: 水产和渔业

    单位: 南京农业大学无锡渔业学院,中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室

    基金: 中国水产科学研究院中央公益事业单位基础研究基金(2017HY-XKQ0203),江苏省自然科学基金(BK20160203)

    分类号: S917.4

    页码: 827-834

    总页数: 8

    文件大小: 282K

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