亚洲棉全基因组KNOX基因家族鉴定及组织表达分析

论文摘要

为探究亚洲棉KNOX基因家族特征及进化关系,本研究在石系亚1号中鉴定到23个KNOX基因（GaKNOX1-GaKNOX23）。23个基因定位于11条染色体上。除GaKNOX6、GaKNOX13、GaKNOX15、GaKNOX20和GaKNOX23外,其他GaKNOX蛋白均含有KNOX1、KNOX2、ELK和HOX 4个典型结构域。GaKNOX基因进化聚类形成两大分支:ClassⅠ和ClassⅡ。转录组数据分析显示,GaKNOX12在开花后20 d的纤维和胚珠中的表达量最高,说明它可能参与调控棉纤维次生壁形成过程。本研究在亚洲棉全基因组水平上鉴定KNOX基因家族并进行生物信息学分析,为进一步研究KNOX基因在棉花中的调控作用奠定基础。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 亚洲棉KNOX家族基因的鉴定
•   1.2 染色体定位与基因复制
•   1.3 进化分析
•   1.4 基因结构示意图绘制
•   1.5 基因表达谱构建
• 2 结果与分析
•   2.1 亚洲棉KNOX基因的鉴定与命名
•   2.2 亚洲棉KNOX基因的染色体定位
•   2.3 亚洲棉KNOX蛋白质结构域分析
•   2.4 亚洲棉KNOX基因结构分析
•   2.5 KNOX蛋白质进化分析
•   2.6 亚洲棉KNOX基因表达分析
• 3 讨论与结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 孙润润,王园园,郭新磊,秦腾飞,张金宝,金翠萍,董涛,王清连

关键词: 亚洲棉,基因,进化分析,基因结构,组织表达

来源: 中国棉花 2019年12期

年度: 2019

分类: 农业科技

专业: 农作物

单位: 河南科技学院现代生物育种河南省协同创新中心,中国农业科学院蔬菜花卉研究所

分类号: S562

页码: 15-22

总页数: 8

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