基于高通量测序技术研究黄栌根际土壤微生物多样性

论文摘要

为了揭示香山公园不同植物配置对黄栌根际土壤微生物群落结构和多样性的影响,采用高通量测序技术（Illumina Mi Seq）对不同年份和不同地点采集的黄栌根际土壤中的真菌进行ITS+5.8S r DNA基因测序、细菌进行16S r DNA基因V3-V4区测序分析。结果表明,2018年香山公园黄栌根际土壤样品中真菌多样性明显高于2016年,而且2018年驯鹿坡健康黄栌根际土壤的真菌多样性高于发病黄栌,有5个土壤样品中黄栌枯萎病菌（Verticillium dahliae）检测为阳性。2018年驯鹿坡发病黄栌根际土壤的细菌多样性最低,而2018年阆凤亭侧柏下健康黄栌根际土壤的细菌多样性最高。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 样品采集
•   1.2 土壤总DNA提取
•   1.3 土壤真菌r RNA（ITS1-ITS2）基因的PCR扩增引物
•   1.4 土壤细菌16S rRNA（V3-V4）基因的PCR扩增引物
•   1.5 PCR扩增体系及扩增和程序
•   1.6 数据分析
• 2 结果与分析
•   2.1 不同土壤样本测序结果及质量控制
•     2.1.1 土壤真菌r RNA（ITS1-ITS2）基因测序结果
•     2.1.2 土壤细菌16s rDNA基因测序结果
•   2.2 不同土壤样品微生物群落丰富度和多样性分析
•     2.2.1 真菌群落多样性分析
•     2.2.2 细菌群落多样性分析
•   2.3 不同土壤样品菌群的分类学组成分析
•     2.3.1 真菌群落的属水平分类学组成
•     2.3.2 细菌群落的属水平分类学组成
• 3 结论与讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 周江鸿,夏菲,车少臣,葛雨萱,周肖红

关键词: 黄栌,枯萎病,根际土壤,微生物多样性,高通量测序

来源: 园林科技 2019年03期

年度: 2019

分类: 工程科技Ⅱ辑,基础科学,农业科技

专业: 生物学,农业基础科学,农艺学,园艺

单位: 园林绿地生态功能评价与调控技术北京市重点实验室北京市园林科学研究院,北京市香山公园管理处,北京市花木有限公司

基金: 北京市公园管理中心科技课题(ZX2018016)

分类号: S154.3;S687

页码: 25-31

总页数: 7

文件大小: 1266K

下载量: 444