导读:本文包含了微矩阵基因芯片论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因芯片,矩阵,基因,差异,食管癌,食管,细胞系。
微矩阵基因芯片论文文献综述
李沛,凌志强,赵继敏,杨洪艳,黄幼田[1]（2008）在《建立cDNA微矩阵基因芯片技术并分析食管癌细胞系Eca109基因表达谱》一文中研究指出为筛选食管癌相关基因,建立并应用cDNA微矩阵技术分析了食管癌细胞系ECa109基因表达谱。结果显示,在886条基因中,ECa109细胞系与正常食管上皮细胞间存在显着差异表达的基因有107条(12.08%),其中表达上调的51条(5.76%),表达下调的56条(6.32%)。定量RT-PCR验证其中2个基因的表达水平,结果一致。建立T7 RNA聚合酶扩增技术,并对比分析了无扩增样品的基因表达谱,两者表现了较好的吻合性,这为cD-NA微阵技术分析原发性食管癌微量肿瘤细胞的基因差异表达谱提供了方法学。食管癌细胞株ECa109基因表达谱的分析也使我们对食管癌病变机制有了一个初步的了解。(本文来源于《生物医学工程学杂志》期刊2008年02期）
李沛,凌志强,赵继敏,杨洪艳,黄幼田[2]（2006）在《EC109细胞cDNA微矩阵基因芯片的建立及其方法学分析》一文中研究指出目的建立食管癌EC109细胞cDNA微矩阵基因芯片,并对其可靠性进行验证。方法提取正常食管上皮细胞和EC109细胞的mRNA,逆转录得cDNA,再逆转录得cRNA,用Cy3-dUTP标记EC109细胞cRNA,用Cy5-dUTP标记正常食管上皮细胞cRNA,制备表达谱探针,利用该探针对EC109细胞与正常食管上皮细胞进行杂交。荧光扫描基因芯片,筛选表达谱。利用自身比较实验、重复实验和R2、一致率(CR)及假阳性率(FPR)等指标对该基因芯片系统进行方法学分析。结果该基因芯片系统2次实验结果的符合率达85%,R2=0.7329,CR=100%。该系统的FPR为0.45%,扩增样品与无扩增样品的基因表达谱表现出较好的吻合性。结论该芯片系统具有良好的稳定性、可靠性及低误差率等特点,可用于基因差异表达谱的分析。(本文来源于《郑州大学学报(医学版)》期刊2006年02期）
明德松,庄建良,王明泉,许荣誉[3]（2004）在《应用微矩阵表达谱基因芯片筛选食管癌新的相关基因》一文中研究指出[目的]应用微矩阵表达谱基因芯片筛选食管癌新的相关基因。[方法]微矩阵表达谱基因芯片(14114种基因)筛选3例食管癌及其对照癌旁组织的差异表达基因,用Northern印迹证实,用末端终止法测序,将测序结果在GenBank数据库进行同源性检索。[结果]检测的3例临床标本中,共有的差异表达基因31条,上调基因10条,下调基因21条,其序列与Genbank数据库比较,从中筛选出2条无明显同源的人类已知基因或片段,即新基因,并列出其序列。[结论]微矩阵表达谱基因芯片可应用于筛选食管癌新的相关基因,其具备高通量、特异性好、快速的特点;食管癌和对照癌旁组织间存在2条新的差异表达基因。(本文来源于《肿瘤学杂志》期刊2004年01期）
李云峰,赵楠,袁本利,罗质璞[4]（2003）在《微矩阵基因芯片筛选抗抑郁剂地昔帕明相关基因的研究》一文中研究指出目的 研究抗抑郁剂相关基因 ,探讨其可能作用机制。方法与结果 以高浓度皮质酮 (Cort) 1 0μmol·L-1或Cort与叁环类经典抗抑郁剂地昔帕明(DIM) 5 μmol·L-1共同处理PC1 2细胞 3d分别作为对照组和实验组 ,按Trizol一步法提取细胞总RNA并纯化mRNA ,将等量的对照组与实验组mRNA以逆转录法分别标记荧光素cy3和cy5 ,合成cDNA探针并等量混合 ,与小鼠 2 0 48点微矩阵基因芯片杂交 ,扫描荧光信号图像并分析比较二组差异表达基因 ,发现DIM与Cort共孵PC1 2细胞 3d可以诱导2 5 9个基因表达水平发生改变。其中 1 63个基因表达降低 ,如葡萄糖调节蛋白 78ku、葡萄糖激酶(GA)、细胞骨架蛋白、转化性生长因子 β受体结合蛋白、细胞色素C氧化酶、锂盐敏感性内消旋肌醇一磷酸酯酶等 ;有 96个基因表达水平升高 ,如神经元生长分化因子 9(GDF 9)、锌指蛋白 2 1 6、细胞色素P45 0、睾丸特异基因 1等。随机选取二个差异表达基因GA和GDF 9,以细胞原位杂交方法验证 ,取得与基因芯片评价一致的结果。结论 抗抑郁剂DIM作用可能与能量代谢、细胞骨架、营养因子、酶等多层次、多水平的基因表达改变有关。本研究利用基因芯片技术对抗抑郁剂相关基因进行了初步探索 ,为深入研究抗抑郁剂作用机制和药物筛选芯片的研发提供了线索与依(本文来源于《中国药理学与毒理学杂志》期刊2003年03期）
庄建良,许荣誉,明德松[5]（2002）在《应用微矩阵表达谱基因芯片检测食管癌的基因改变》一文中研究指出目的 应用微矩阵表达谱基因芯片研究食管癌的基因变化。方法 按一步法抽提叁例食管癌及其对照癌旁组织的总RNA ,分别逆转录成荧光分子掺入的探针 ,混合后杂交基因芯片(1 4 1 1 4种基因 )。经严格洗片后用扫描仪扫描芯片荧光信号图像 ,计算机分析后比较两种组织中差异表达的基因。结果 在所检测的 3例临床标本中 ,共有的差异表达基因 31条 ,上调基因 1 0条 ,下调基因 2 1条 ,有多类基因 ,有与信号转导有关、与细胞周期调控有关、与癌基因同源的基因等等。结论 食管癌和对照癌旁组织间存在差异表达的基因(本文来源于《中华实验外科杂志》期刊2002年06期）
田振军,张志琪,唐量,郭进,刘健[6]（2002）在《应用cDNA微矩阵基因芯片筛选运动性心肌肥大相关基因的初步研究》一文中研究指出目的 :应用cDNAchip(cDNA芯片或微矩阵基因芯片 )技术筛选运动性心肌肥大相关基因。方法 :摘取运动组和对照组小鼠心脏 ,按一步法抽提总RNA并纯化mRNA ,将 2 30 4个点包括10 3个阴性及对照基因和 2 2 0 1条小鼠靶基因的PCR扩增产物 ,按微矩阵 (12× 12点× 16亚矩阵 ,点间距离 375 μm)点制于硅烷化玻片上 ,制备成cDNA芯片。将等量抽提纯化的运动组和对照组小鼠心肌组织mRNA ,分别与掺入的荧光分子Cy3和Cy5经逆转录合成cDNA荧光探针 ,混合后再与cD NA芯片杂交 ,通过芯片扫描仪对荧光信号图像进行扫描 ,经计算机分析比较运动组和安静对照组心肌组织中基因表达谱的变化。结果 :在 2 2 0 1条待研究基因中 ,两组小鼠心肌组织间存在差异表达的基因。具有显着表达差异的基因有 71条 ,其中上调基因有 37条 ,下调基因有 34条。结果显示 :cDNA芯片技术筛选运动性心肌肥大相关基因具有高通量、高敏度、高效率、大规模和并行性等优点。(本文来源于《中国运动医学杂志》期刊2002年02期）
陈菊祥,范静平,应康,廖建春,李瑶[7]（2000）在《微矩阵基因芯片筛选喉鳞癌相关基因的研究》一文中研究指出目的 :应用基因微矩阵方法筛选喉鳞癌相关基因。方法 :按一步法抽提喉鳞癌和对照喉正常组织的总 RNA并纯化m RNA;将 40 96种人类基因 PCR产物用 Cartesian Pixsys75 0 0点样仪按微矩阵排列点样于化学涂层的载玻片上 ,制成基因芯片 ;将等量的对照组织和喉鳞癌组织 m RNA分别逆转录合成荧光分子掺入的 c DNA一链做探针 ,混合后杂交上述基因芯片。经严格洗片后用 Scan Array30 0 0扫描仪扫描芯片荧光信号图像 ,计算机分析后比较两种组织中差异表达的基因。结果 :在 40 96种基因中 ,喉鳞状细胞癌与喉正常组织间存在差异表达的基因。所检测的 4例临床标本中 ,2例共有的差异表达基因2 11～ 35 6条 (5 .15 %～ 8.87% ) ,3例共有的差异表达基因 36条 (0 .88% )。结论 :基因微矩阵芯片在筛选喉肿瘤发生相关基因的改变具有快速、高通量、高敏度等特点。(本文来源于《第二军医大学学报》期刊2000年09期）
微矩阵基因芯片论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的建立食管癌EC109细胞cDNA微矩阵基因芯片,并对其可靠性进行验证。方法提取正常食管上皮细胞和EC109细胞的mRNA,逆转录得cDNA,再逆转录得cRNA,用Cy3-dUTP标记EC109细胞cRNA,用Cy5-dUTP标记正常食管上皮细胞cRNA,制备表达谱探针,利用该探针对EC109细胞与正常食管上皮细胞进行杂交。荧光扫描基因芯片,筛选表达谱。利用自身比较实验、重复实验和R2、一致率(CR)及假阳性率(FPR)等指标对该基因芯片系统进行方法学分析。结果该基因芯片系统2次实验结果的符合率达85%,R2=0.7329,CR=100%。该系统的FPR为0.45%,扩增样品与无扩增样品的基因表达谱表现出较好的吻合性。结论该芯片系统具有良好的稳定性、可靠性及低误差率等特点,可用于基因差异表达谱的分析。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
微矩阵基因芯片论文参考文献
[1].李沛,凌志强,赵继敏,杨洪艳,黄幼田.建立cDNA微矩阵基因芯片技术并分析食管癌细胞系Eca109基因表达谱[J].生物医学工程学杂志.2008
[2].李沛,凌志强,赵继敏,杨洪艳,黄幼田.EC109细胞cDNA微矩阵基因芯片的建立及其方法学分析[J].郑州大学学报(医学版).2006
[3].明德松,庄建良,王明泉,许荣誉.应用微矩阵表达谱基因芯片筛选食管癌新的相关基因[J].肿瘤学杂志.2004
[4].李云峰,赵楠,袁本利,罗质璞.微矩阵基因芯片筛选抗抑郁剂地昔帕明相关基因的研究[J].中国药理学与毒理学杂志.2003
[5].庄建良,许荣誉,明德松.应用微矩阵表达谱基因芯片检测食管癌的基因改变[J].中华实验外科杂志.2002
[6].田振军,张志琪,唐量,郭进,刘健.应用cDNA微矩阵基因芯片筛选运动性心肌肥大相关基因的初步研究[J].中国运动医学杂志.2002
[7].陈菊祥,范静平,应康,廖建春,李瑶.微矩阵基因芯片筛选喉鳞癌相关基因的研究[J].第二军医大学学报.2000
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