草莓不同生育期根际微生物的动态变化

草莓不同生育期根际微生物的动态变化

论文摘要

【目的】为消除草莓连作导致的土传病害,保证土壤生态环境的良性循环。【方法】采用Illumina Miseq高通量测序技术研究了草莓(红颜)恢复生长期、现蕾期、开花和结果期以及盛果期5个生育期根际微生物群体的动态变化。【结果】结果表明:随着草莓生育期的变化,草莓根际土壤细菌和真菌群落丰富度和多样性及主要种群相对丰度均发生了显著变化。细菌丰富度随生育期的变化而逐渐上升,细菌群落多样性在恢复生长期、开花和结果期时下降,在现蕾期、盛果期和生长末期时上升。真菌丰富度和多样性均在现蕾期时显著升高。草莓各生育期根际土壤中细菌相对丰度较高的有变形菌门(Proteobacteria)和酸杆菌门(Acidobacteria),Pseudomonas为整个生育期的优势菌属。变形菌门的相对丰度随着草莓的生长发育而逐渐升高,酸杆菌门的相对丰度随草莓生育期的延长出现不同程度的下降。真菌相对丰度最高的是子囊菌门(Ascomycota),Chaetomium为真菌的优势菌属。子囊菌门相对丰度在恢复生长期和现蕾期下降,开花和结果期上升,盛果期和生长末期又下降,尤其在现蕾期时相对丰度显著下降。【结论】根际微生物随草莓生育期的变化而显著变化,现蕾期时微生物群落丰富度和多样性最高。Pseudomonas和Chaetomium在草莓整个生育期内均属于优势菌属。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 样品的采集
  •   1.2 土壤DNA提取
  •   1.3 MiSeq及数据分析
  •     1.3.1 细菌16SrDNA PCR扩增反应
  •     1.3.2 真菌18SrDNA PCR扩增反应
  •     1.3.3 序列分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 生物学信息分析
  •   2.2 草莓不同生育期根际土壤细菌相对丰度的变化
  •   2.3 草莓不同生育期根际土壤真菌相对丰度的变化
  • 3 讨论和结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 仝利红,高洁,靳永胜

    关键词: 草莓,根际,高通量,群落,多样性,丰富度

    来源: 北京农学院学报 2019年04期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,农业基础科学,农艺学,植物保护,园艺

    单位: 北京农学院植物科学技术学院,北京农学院生物科学与工程学院

    基金: 国家重点研发计划项目(2018YFD0500202)

    分类号: S154.3;S436.68

    DOI: 10.13473/j.cnki.issn.1002-3186.2019.0403

    页码: 10-15

    总页数: 6

    文件大小: 3264K

    下载量: 222

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