蛋白质工程:从定向进化到计算设计

蛋白质工程:从定向进化到计算设计

论文摘要

定向进化通过建立突变体文库与高通量筛选方法,快速提升蛋白的特定性质,是目前蛋白质工程最为常用的蛋白质设计改造策略。近十年随着计算机运算能力大幅提升以及先进算法不断涌现,计算机辅助蛋白质设计改造得到了极大的重视和发展,成为蛋白质工程新开辟的重要方向。以结构模拟与能量计算为基础的蛋白质计算设计不但能改造酶的底物特异性与热稳定性,还可从头设计具有特定功能的人工酶。近年来机器学习等人工智能技术也被应用于计算机辅助蛋白质设计改造,并取得瞩目的成绩。文中介绍了蛋白质工程的发展历程,重点评述当前计算机辅助蛋白质设计改造方面的进展与应用,并展望其未来发展方向。

论文目录

  • 1 定向进化与半理性设计
  •   1.1 定向进化
  •   1.2 半理性设计
  • 2 计算机辅助蛋白质设计
  •   2.1 概述
  •   2.2 蛋白质从头设计
  •   2.3 酶的底物选择性与热稳定性设计
  •   2.4 人工智能技术在计算设计中的应用
  • 3 结论及展望
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 曲戈,朱彤,蒋迎迎,吴边,孙周通

    关键词: 蛋白质工程,计算设计,结构模拟,能量函数,人工智能

    来源: 生物工程学报 2019年10期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,工程科技Ⅰ辑

    专业: 化学

    单位: 中国科学院天津工业生物技术研究所,中国科学院微生物研究所

    基金: 中国科学院率先行动“百人计划”项目(No.2016-053)资助~~

    分类号: O629.73

    DOI: 10.13345/j.cjb.190221

    页码: 1843-1856

    总页数: 14

    文件大小: 1856K

    下载量: 1429

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