红球菌跨膜运输荧蒽的差异膜蛋白分析

论文摘要

提取不同时间荧蒽诱导下红球菌BAP-1分泌的膜蛋白,利用同位素标记相对和绝对定量技术（iTRAQ技术）结合液相二级质谱对差异膜蛋白进行聚类以及生物信息学分析.旨在从蛋白质层面上研究红球菌BAP-1跨膜运输荧蒽过程中起关键作用的膜蛋白种类及其作用机制.结果共鉴定到172个差异膜蛋白.通过差异膜蛋白的COG和GO功能分析,发现荧蒽的加入主要影响了红球菌BAP-1细胞膜上与能量、转运相关的膜蛋白.ABC转运蛋白和TonB依赖转运蛋白作为微生物主要的载体蛋白对BAP-1跨膜运输荧蒽起到了重要作用.过氧化氢酶和超氧化物歧化酶在第6d有一个显著上调,作为抗氧化防御机制来保护微生物.各种膜蛋白在不同阶段发挥着各自作用,这些蛋白共同组成蛋白互作网络调控红球菌BAP-1的跨膜运输过程.

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 菌种培养
•   1.2 试剂和仪器
•     1.2.1 培养基
•     1.2.2 实验仪器
•   1.3 实验方法
•     1.3.1 实验设置
•     1.3.2 红球菌膜蛋白提取
•     1.3.3 蛋白酶解和肽段标记
•     1.3.4肽段分离
•     1.3.5 高效液相
•     1.3.6 质谱检测
•     1.3.7 蛋白质分析
• 2 结果与分析
•   2.1 差异蛋白聚类分析
•   2.2 差异蛋白COG功能分类
•   2.3 差异蛋白的GO富集分析
• 3 讨论
•   3.1 组别1d/0d中的差异膜蛋白
•   3.2 组别3d/1d中的差异膜蛋白
•   3.3 组别6d/3d中的差异膜蛋白
• 4 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 孔德康,李艺,王红旗,许洁,关晶晶

关键词: 红球菌,荧蒽,膜蛋白,跨膜运输

来源: 中国环境科学 2019年01期

年度: 2019

分类: 工程科技Ⅰ辑,基础科学

专业: 生物学,环境科学与资源利用

单位: 北京师范大学水科学研究院,广西师范大学环境与资源学院

基金: 国家自然科学基金资助面上项目(41372232),广西高校重点实验室研究基金资助项目(YRHJ152024),广西自然科学基金青年基金资助项目(2017GXNSFBA198168)

分类号: X172

DOI: 10.19674/j.cnki.issn1000-6923.2019.0033

页码: 274-280

总页数: 7

文件大小: 855K

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