导读:本文包含了基因芯片技术论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因芯片,技术,微生物,异烟肼,利福平,通量,差异。
基因芯片技术论文文献综述
孙桂英,赵刚,沈燕,徐密琴,高胜利[1]（2019）在《基因芯片技术对结核分枝杆菌利福平及异烟肼的耐药性检测研究》一文中研究指出目的考察基因芯片技术检测结核分枝杆菌(Mtb)对利福平(RFP)与异烟肼(INH)耐药性的效果。方法选取苏州市吴江区第一人民医院感染科发现的痰液涂片阳性的结核病患者纳入研究。采用基因芯片技术检测Mtb对RFP与INH的耐药性,并与传统药敏试验结果进行对比,同时采用DNA测序进行验证。结果基因芯片检测RFP耐药的符合率为97.47%,灵敏度为94.90%,特异度为97.81%,阳性预测值为85.32%,阴性预测值为99.31%,Kappa值为0.952;检测INH耐药的符合率为94.45%,灵敏度为78.16%,特异度为99.84%,阳性预测值为99.38%,阴性预测值为93.25%,Kappa值为0.823;检测MDR的符合率为97.83%,灵敏度为82.50%,特异度为99.47%,阳性预测值为94.29%,阴性预测值为98.16%,Kappa值为0.927;经DNA测序验证,基因芯片检测RFP与INH耐药准确率分别为99.52%与99.76%。结论 rpoB531、526位点突变与katG315位点突变可能是苏州吴江地区Mtb产生RFP和INH耐药的关键性分子机制,基因芯片技术能快速且高准确度地检测出这些位点的突变情况,对INH耐药检测的灵敏度尚有较大提升空间。(本文来源于《国际检验医学杂志》期刊2019年23期）
施洋,樊官伟,候宝林,樊登峰,张伟[2]（2019）在《采用基因芯片技术研究丹红注射液对急性心肌梗死模型大鼠基因表达谱的影响》一文中研究指出目的:探讨丹红注射液(DHI)对急性心肌梗死(AMI)模型大鼠基因表达谱的影响。方法:将雄性SD大鼠随机分为假手术组、模型组和DHI组(0.76 m L/kg),每组10只。模型组和DHI组采用冠状动脉左前降支结扎法复制AMI模型。造模后,假手术组和模型组大鼠均肌内注射等容生理盐水,DHI组大鼠肌内注射相应药物,每日1次,连续14 d。末次给药后,分离大鼠梗死边缘区心肌组织,采用基因芯片技术检测基因表达谱的变化情况,以相对表达量差异倍数为指标,筛选差异表达微RNA(miRNA)。在检索其对应基因的基础上,利用DAVID生物信息学资源数据库和KEGG通路数据库分别进行基因本体(GO)和KEGG通路富集分析;借助TargetScan数据库预测差异表达miRNA对应的靶基因信使RNA(mRNA),采用Cytoscape 3.6.1软件构建miRNAmRNA网络并进行分析,采用Agilent GeneSpring GX v11.5软件筛选上述网络中与炎症相关的靶基因和miRNA。结果:与假手术组比较,模型组差异表达miRNA共22个,其中上调5个、下调17个;与模型组比较,DHI组差异表达miRNA共26个,均为上调;与DHI治疗AMI有关的差异表达miRNA包括rno-let-7a-5p、rno-let-7d-5p、rno-let-7f-5p、rno-miR-26b-5p、rno-miR-29b-3p、cel-miR-39-3p、cel-miR-39-5p、rno-miR-142-5p、rno-miR-191a-5p、rno-miR-409a-3p。GO和KEGG通路富集分析结果显示,差异表达miRNA对应基因主要集中在膜结合细胞器、细胞质、内膜系统等细胞组分中,通过解剖结构发育、多细胞组织发育、发育过程等生物过程来发挥蛋白结合、离子结合等分子功能;其主要富集于钙信号通路,过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路,血管内皮生长因子(VEGF)信号通路,细胞凋亡,糖基磷脂酰肌醇锚定生物合成,缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸降解等信号通路上。miRNA-mRNA网络分析结果显示,与差异表达miRNA对应的靶基因mRNA共25个,与之关联的miRNA共24个;该网络中与炎症相关的靶基因共6个(IL6、IL1b、TNF、TLR4、CRP、CXCL12),涉及差异表达miRNA共19个。结论:DHI对AMI的治疗作用可能与调节相关miRNA的表达,影响钙离子、PPAR、VEGF等通路的信号转导,调控白细胞介素、趋化因子、C反应蛋白等炎症标志物的分泌有关。(本文来源于《中国药房》期刊2019年22期）
杨艳兵,胡海英,吴茱萸,张丽娜,周敬奎[3]（2019）在《基因芯片技术在成人下呼吸道感染病原学检测中的临床应用及评价》一文中研究指出目的调查了解成人下呼吸道感染的病原谱,评价基因芯片检测技术在成人下呼吸道感染病学检测中的临床应用价值。方法留取因下呼吸道感染住院的成人患者下呼吸道标本,分别进行常规培养及29种病原体基因芯片法检测,并对检测结果进行统计分析。结果共入组451例患者,A组(18～45岁)63例,B组(45～60岁)95例,C组(>60岁)293例;基因芯片法病毒的总检出率为77.61%,C组较高,但差异无统计学意义(χ~2=4.97,P>0.05)。基因芯片法细菌的总检出率为59.20%,阳性菌以肺炎链球菌为主,A组患者检出率较高,但差异无统计学意义(χ~2=1.38,P>0.05);阴性菌以流感嗜血杆菌及鲍曼不动杆菌为主,流感嗜血杆菌在B组患者检出率较高,但差异无统计学意义(χ~2=5.73,P>0.05),非发酵菌在C组患者检出率较高,但差异无统计学意义(χ~2=4.72,P>0.05),肠杆菌科细菌在C组患者检出率较高,差异有统计学意义(χ~2=9.83,P<0.05)。基因芯片法白色念珠菌的总检出率为28.60%, C组较高,差异有统计学意义(χ~2=7.06,P<0.05)。基因芯片检测与流感病毒感染临床诊断对比,总符合率为80.93%,敏感度18.75%,特异度94.34%,阳性预测值41.67%,阴性预测值84.34%;与传统细菌培养结果对比,总符合率为83.59%,敏感度50.45%,特异度94.41%,阳性预测值74.67%。结论病毒检出率较高,阳性菌以肺炎链球菌为主,阴性菌以流感嗜血杆菌及鲍曼不动杆菌为主,不典型病原体较少见;病毒、阴性菌及真菌在>60岁患者检出率较高;与传统培养法及流感临床拟诊相比,基因芯片检测技术有较高的符合率、特异度及阴性预测值。(本文来源于《广东医学》期刊2019年21期）
李元政,胡文忠,龙娅,冯可,萨仁高娃[4]（2019）在《基因芯片检测技术及其在食源性病原微生物检测中的应用》一文中研究指出基因芯片是将寡核苷酸探针阵列固定在微小芯片载体上,通过核酸杂交与计算机数据分析可对待测样品的遗传信息进行大规模检测。它作为一种新型微量检测分析技术,以其可同时、快速、精准地分析数以千计基因组信息的本领而显示出了巨大的潜力。基因芯片检测技术在临床医学、食品检测与安全、植物病理学等领域得到非常广泛的应用。本文综述了基因芯片检测技术的分类及发展,系统的将基因芯片按探针长度、载体材料、制作方法、芯片功能、应用领域等不同的分类方法分为寡核苷酸芯片、硅芯片、原位合成芯片、基因表达谱芯片或各种专用型芯片等多种不同的芯片,并对其主要检测程序进行了总结,对基因芯片检测技术在食源性病原微生物研究中的应用,分析其存在的问题并进行展望,以期为之后基因芯片检测技术在食源性病原微生物检测与研究等提供一定理论基础研究。(本文来源于《中国食品科学技术学会第十六届年会暨第十届中美食品业高层论坛论文摘要集》期刊2019-11-13）
冯云霞,张介眉,谢沛霖,郝建军,朱旭[5]（2019）在《利用基因芯片技术研究葱白提取物对血脂的调控基因》一文中研究指出目的利用基因芯片技术探讨葱白提取物调节血脂的可能机制。方法利用高脂饲料法建立高脂血症模型,葱白提取物组给予葱白提取物灌胃6周,造模成功后分别提取模型组和葱白提取物组肝脏组织的总RNA,标记后与OneArray?大鼠基因芯片杂交,洗脱、染色、扫描芯片,GCOS软件分析和处理数据;运用实时荧光定量PCR技术对Fgf21、Scap基因进行验证。结果按照表达差异倍数大于等于2,P<0.05的筛选条件,筛选出高脂血症模型组和葱白提取物组差异基因有58个,其中表达上调的基因16个,表达下调的基因42个。经PCR验证:与模型组相比,葱白提取物可以明显上调Fgf21的表达(P<0.05),而对Scap的表达影响不大,这与基因芯片结果一致。结论基因芯片技术是一高效筛选葱白提取物调节血脂相关基因的方法,Cpt1b、Cidea、Lcn2、Fgf21、Scd等基因可能与葱白提取物调节血脂机制相关。(本文来源于《重庆医学》期刊2019年20期）
张枥心[6]（2019）在《利用基因芯片技术研究缺氧/复氧条件下抑制miR-132表达对人视网膜微血管内皮细胞中基因表达的影响》一文中研究指出目的本实验旨在利用基因芯片技术研究缺氧/复氧(H/R)条件下抑制miR-132表达对缺氧/复氧条件下人视网膜微血管内皮细胞(HRMEC)中基因表达水平的影响。方法选用HRMEC细胞株,缺氧条件下培养6 h,然后再常氧条件下培养6 h,作为H/R组;在H/R条件下,添加miR-132的抑拮抗剂(anti-miR-132)作为H/R+anti-miR-132组;常氧条件下培养的HRMEC为阴性对照组。提取细胞中mRNA,使用mRNA微阵列(HOA 7.1)芯片检测基因表达,然后采用软件包Rosetta Resolver 7.2进行基因本体(GO)分析。结果①H/R显着上调CDH13、COL17A1、TNC、MMP14的表达,下调TFAP2C、HPGD、IL18的表达,miR-132是上述表达调控中"必需程度"接近100%的中间执行者;②H/R上调了TCF4、CXCL8、ANGPTL4、PLAT、PLAU、THY1、GPC6、COL5A2和VCAN的表达,下调了CEBPA、DCN、 PI3的表达,miR-132是上述表达调控中的中间执行者之一,还存在其他的中间执行者;③通过分子生物功能分析发现IL18、ANGPTL4、PI3与视网膜新生血管(RNV)密切相关,并且COL17A1、MMP14、CXCL8、PLAT、PLAU、THY1、GPC6、VCAN有可能参与RNV。结论通过基因芯片检测发现miR-132介导了H/R对部分基因的调节,其中部分基因有可能参与RNV的发生、发展,为进一步阐明miR-132调节RNV的机制提供研究基础。(本文来源于《中国眼耳鼻喉科杂志》期刊2019年05期）
郭志平,陈晓红,吴国兰,翁丽珍,黄明翔[7]（2019）在《基因芯片技术检测初治涂阴肺结核患者肺泡灌洗液的临床意义》一文中研究指出目的分析基因芯片技术检测初治涂阴肺结核患者肺泡灌洗液的临床意义。方法应用基因芯片技术对200份初步诊断初治涂阴肺结核患者肺泡灌洗液标本进行菌属鉴定,鉴定为结核分枝杆菌者进一步行异烟肼和利福平耐药相关基因检测,同时以BACTEC MGIT960液体快速培养及药敏结果为对照,比较2种检测方法的差异性。结果 200份肺泡灌洗液标本中,基因芯片技术鉴定出2份鸟分枝杆菌及8份胞内分枝杆菌,结果与BACTEC MGIT960液体快速培养一致。基因芯片异烟肼耐药相关基因inh A及kat G基因突变检出率与960液体药敏异烟肼耐药检出率相同(18. 4%,9/49),比较差异无统计学意义(P> 0. 05);以960液体药敏结果为金标准,基因芯片检测异烟肼耐药相关基因kat G或inh A突变的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值及kappa值分别为88. 9%、97. 5%、88. 9%、97. 5%及0. 864。在8例960液体药敏结果利福平耐药患者中,基因芯片均检测到rpo B基因突变。结论对于痰结核菌涂片阴性,高度疑似肺结核患者,可通过纤支镜进行肺泡灌洗,利用基因芯片技术对灌洗液进行检测,可早期快速诊断肺结核、NTM肺病及明确异烟肼和利福平耐药情况,为临床后续治疗提供依据,值得临床推广应用。(本文来源于《临床合理用药杂志》期刊2019年26期）
方桂桔,张灿辉,刘志新,吴廷文[8]（2019）在《高通量检测基因芯片测序技术对COPD合并社区获得性肺炎病原体检测可行性研究》一文中研究指出目的探讨高通量检测基因芯片测序技术对慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)合并社区获得性肺炎病原体检测可行性。方法选择2017年1月至2018年5月在我院接受治疗的128例疑似COPD并发社区获得性肺炎患者进行研究。所有患者均在使用抗生素前采集合格痰标本、肺泡灌洗液标本,均同时进行病原学临床检测和高通量测序,并对高通量测序的结果采用PCR方法进行确认,然后对基于高通量测序的慢阻肺合并肺炎病原体检测方法进行评估。参照《中国成人社区获得性肺炎诊断和治疗指南(2016年版)》中致病原的主要检测方法及其相应的诊断标准为金标准,对临床检验及高通量检测基因芯片测序技术的诊断效能进行分析。结果临床检测对COPD合并社区获得性肺炎病原体检测诊断效能:灵敏度=81.52%,特异度=63.89%,准确度=76.56%,阳性预测值=85.23%,阴性预测值=57.50%。高通量检测基因芯片测序对COPD并发社区获得性肺炎病原体检测诊断效能:灵敏度=91.43%,特异度=82.61%,准确度=89.84%,阳性预测值=96.00%,阴性预测值=82.61%。高通量检测灵敏度、特异度、准确度、阳性预测值、阴性预测值等诊断效能指标均明显高于临床检测(P<0.05)。高通量病原体检出阳性率明显高于临床检验(P<0.05),在肺炎链球菌及流感嗜血杆菌方面差异无统计学意义(P>0.05),在人腺病毒方面高通量病原体检出阳性率明显高于临床检验(P<0.05)。结论高通量检测基因芯片测序技术对COPD合并社区获得性肺炎病原体检测灵敏度、特异度、准确度、阳性预测值、阴性预测值等诊断效能指标均明显高于临床检测,该方法操作方便、诊断价值较高。(本文来源于《临床肺科杂志》期刊2019年09期）
张新翊[9]（2019）在《基因芯片技术在食品检测中的应用》一文中研究指出本文围绕基因芯片技术,就其在食品中营养成分、原料、微生物及转基因食品检测中的应用作探讨,望能为此领域研究提供借鉴与帮助。(本文来源于《食品安全导刊》期刊2019年24期）
郜琳,王倩,刘永政[10]（2019）在《基于基因芯片技术研究焦虑抑郁障碍对女性高血压患者基因表达谱的影响》一文中研究指出根据世界卫生组织的数据,全球大约叁分之一的成年人伴有血压升高,其中一半的人将罹患中风或心脏疾病[1]。随着经济的高速发展,社会节奏不断加快,越来越多的人患有焦虑抑郁障碍(ADC)等精神疾病。研究表明,ADC与多种疾病的发生发展密切相关[2]。流行性病学调查表明,焦虑使非高血(本文来源于《中国实验诊断学》期刊2019年07期）
基因芯片技术论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的:探讨丹红注射液(DHI)对急性心肌梗死(AMI)模型大鼠基因表达谱的影响。方法:将雄性SD大鼠随机分为假手术组、模型组和DHI组(0.76 m L/kg),每组10只。模型组和DHI组采用冠状动脉左前降支结扎法复制AMI模型。造模后,假手术组和模型组大鼠均肌内注射等容生理盐水,DHI组大鼠肌内注射相应药物,每日1次,连续14 d。末次给药后,分离大鼠梗死边缘区心肌组织,采用基因芯片技术检测基因表达谱的变化情况,以相对表达量差异倍数为指标,筛选差异表达微RNA(miRNA)。在检索其对应基因的基础上,利用DAVID生物信息学资源数据库和KEGG通路数据库分别进行基因本体(GO)和KEGG通路富集分析;借助TargetScan数据库预测差异表达miRNA对应的靶基因信使RNA(mRNA),采用Cytoscape 3.6.1软件构建miRNAmRNA网络并进行分析,采用Agilent GeneSpring GX v11.5软件筛选上述网络中与炎症相关的靶基因和miRNA。结果:与假手术组比较,模型组差异表达miRNA共22个,其中上调5个、下调17个;与模型组比较,DHI组差异表达miRNA共26个,均为上调;与DHI治疗AMI有关的差异表达miRNA包括rno-let-7a-5p、rno-let-7d-5p、rno-let-7f-5p、rno-miR-26b-5p、rno-miR-29b-3p、cel-miR-39-3p、cel-miR-39-5p、rno-miR-142-5p、rno-miR-191a-5p、rno-miR-409a-3p。GO和KEGG通路富集分析结果显示,差异表达miRNA对应基因主要集中在膜结合细胞器、细胞质、内膜系统等细胞组分中,通过解剖结构发育、多细胞组织发育、发育过程等生物过程来发挥蛋白结合、离子结合等分子功能;其主要富集于钙信号通路,过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路,血管内皮生长因子(VEGF)信号通路,细胞凋亡,糖基磷脂酰肌醇锚定生物合成,缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸降解等信号通路上。miRNA-mRNA网络分析结果显示,与差异表达miRNA对应的靶基因mRNA共25个,与之关联的miRNA共24个;该网络中与炎症相关的靶基因共6个(IL6、IL1b、TNF、TLR4、CRP、CXCL12),涉及差异表达miRNA共19个。结论:DHI对AMI的治疗作用可能与调节相关miRNA的表达,影响钙离子、PPAR、VEGF等通路的信号转导,调控白细胞介素、趋化因子、C反应蛋白等炎症标志物的分泌有关。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
基因芯片技术论文参考文献
[1].孙桂英,赵刚,沈燕,徐密琴,高胜利.基因芯片技术对结核分枝杆菌利福平及异烟肼的耐药性检测研究[J].国际检验医学杂志.2019
[2].施洋,樊官伟,候宝林,樊登峰,张伟.采用基因芯片技术研究丹红注射液对急性心肌梗死模型大鼠基因表达谱的影响[J].中国药房.2019
[3].杨艳兵,胡海英,吴茱萸,张丽娜,周敬奎.基因芯片技术在成人下呼吸道感染病原学检测中的临床应用及评价[J].广东医学.2019
[4].李元政,胡文忠,龙娅,冯可,萨仁高娃.基因芯片检测技术及其在食源性病原微生物检测中的应用[C].中国食品科学技术学会第十六届年会暨第十届中美食品业高层论坛论文摘要集.2019
[5].冯云霞,张介眉,谢沛霖,郝建军,朱旭.利用基因芯片技术研究葱白提取物对血脂的调控基因[J].重庆医学.2019
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[8].方桂桔,张灿辉,刘志新,吴廷文.高通量检测基因芯片测序技术对COPD合并社区获得性肺炎病原体检测可行性研究[J].临床肺科杂志.2019
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