基于功率谱分析的基因编码序列单碱基突变研究

论文摘要

针对DNA序列单碱基的不同类型突变,利用数字信号处理方法,研究了单碱基替换突变、删除突变、插入突变对DNA序列三周期功率谱的影响。研究结果表明:对于不同长度的编码序列,替换突变对序列功率谱的影响较小,删除突变和插入突变对序列功率谱的影响较大;随着序列编码区长度的减小,替换、删除、插入突变对序列编码区的功率谱影响会越来越大。对于中等长度外显子,插入突变对序列三周期功率谱影响最大,对于短外显子,删除突变对序列三周期功率谱的影响最大。研究结果可为含突变基因编码区的识别与检测提供参考。

论文目录

• 1 结果与分析
•   1.1 单碱基突变对长外显子序列三周期特性的影响
•   1.2 单碱基突变对中等长度外显子序列三周期特性的影响
•   1.3 单碱基突变对短外显子序列三周期特性的影响
• 2 讨论
• 3 材料与方法
•   3.1 DNA序列的数值映射
•   3.2 功率谱分析
• 作者贡献

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 耶晓东,张军英

关键词: 单碱基,功率谱,外显子,突变

来源: 基因组学与应用生物学 2019年02期

年度: 2019

分类: 基础科学,医药卫生科技

专业: 生物学

单位: 陕西理工大学物电学院,西安电子科技大学计算机学院

基金: 基本科研业务费—自由探索类项目(JBZ170301)资助

分类号: Q75

DOI: 10.13417/j.gab.038.000563

页码: 563-567

总页数: 5

文件大小: 213K

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