疾病相关miRNAs识别方法研究进展

疾病相关miRNAs识别方法研究进展

论文摘要

miRNAs是一类内源性短序列非编码RNAs小分子,广泛参与细胞的增殖、分化、凋亡等生物学过程.miRNAs的异常表达与包括肿瘤在内的多种复杂疾病的发生、发展有着密切的关系,筛选与疾病相关的miRNAs,对于药物靶点的发现及新型药物的开发,具有十分重要的作用.笔者拟通过逐步递进的方式,从miRNA靶基因预测、miRNA生物功能作用机制、疾病相关miRNAs计算筛选方法、miRNA小分子药物多个方面,综述疾病相关miRNAs研究进展,为推进miRNA在临床医学中的应用提供参考.

论文目录

  • 0 引 言
  • 1 miRNA基本概念
  •   1.1 miRNA定义
  •   1.2 miRNA命名规则
  • 2 miRNA靶基因预测方法
  •   2.1 ab initio方法
  •     (1) miRanda[20-21]:
  •     (2) TargetScan[23-24]:
  •     (3) PicTar[26]:
  •     (4) DIANA-microT:
  •     (5) PITA[28]:
  •   2.2 机器学习预测方法
  •     (1) TargetBoost[29]:
  •     (2) miTarget[30]:
  •     (3) MiRTif[31]:
  •     (4) MTar[32]:
  •     (5) miRTDL[33]:
  • 3 miRNA调控机制
  • 4 疾病相关miRNAs筛选方法
  •   (1) 基于miRNA表达差异分析方法
  •   (2) 基于miRNA表达量的排序方法
  •   (3) 基于miRNA功能相似性网络方法
  • 5 miRNA与小分子药物
  • 6 总 结
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 许鹏,昝乡镇,路德杨,饶永生,刘文斌

    关键词: 疾病相关,靶基因,小分子药物

    来源: 广州大学学报(自然科学版) 2019年01期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,医药卫生科技

    专业: 生物学,基础医学

    单位: 广州大学计算科技研究院,温州职业技术学院信息技术系,广州大学人事处,广东省数学教育软件工程技术研究中心

    基金: 国家自然科学基金资助项目(61572367,61272018,61573017和11701118),2016年贵州省科技平台及人才团队专项资金资助项目(黔科合平台人才[2016]5609),2016年贵州省省级重点支持学科“计算机应用技术”(黔学位合字ZDXK[2016]20号)资助项目

    分类号: R346;Q811.4

    页码: 50-60

    总页数: 11

    文件大小: 410K

    下载量: 112

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