基于Illumina MiSeq高通量测序技术分析广西无盐发酵酸笋中细菌多样性

论文摘要

以10年老酸水泡制酸笋样品(BSFAF)、发酵6个月块状酸笋(MBSF)和丝状酸笋样品(FBSF)为研究对象,应用Illumina Mi Seq高通量测序技术并通过生物信息统计与分析,探索广西无盐发酵酸笋样品中细菌菌群结构及多样性。结果表明:3组酸笋样品共得到148 656个有效的序列数(Tags),聚类后总共得到1 116个分类操作单元(OTUs)。根据物种注释结果,在3组酸笋样品中共注释到12个门、23个纲、37个目、98个科和190个属。在门分类水平上,3组样品中厚壁菌门(Firmicutes)占绝对优势,其次是变形杆菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria);在属分类水平上,乳杆菌属(Lactobacillus)、乳球菌属(Lactococcus)和魏斯氏菌属(Weissella)是3组样品中的优势菌属。其中,丝状酸笋(FBSF)组的香农(Shannon)、辛普森(Simpson)及ACE指数均显著高于其他两组,且乳杆菌属(Lactobacillus)、乳球菌属(Lactococcus)和魏斯氏菌属(Weissella)的平均相对丰度总和最高,可达99.8%。因此,以泉水泡制发酵丝状竹笋生产酸笋可能更佳。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 材料与试剂
•     1.1.1 材料
•     1.1.2 化学试剂
•   1.2 仪器与设备
•   1.3 试验方法
•     1.3.1 酸笋制作方法
•     1.3.2 酸笋样品总DNA提取
•     1.3.3 酸笋16S r DNA高通量测序方法
•     1.3.4 数据分析
•     1.3.5 数据处理
• 2 结果与分析
•   2.1 三个不同样品测序数据统计分析
•   2.2 三个不同样品OTUs统计及分类学分析
•   2.3 三个不同样品Alpha多样性分析
•   2.4 三种不同样品Beta多样性分析
•   2.5 三种不同样品中物种注释及分类
• 3 结论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 周金沙,陈晓艺,谭金萍,陈梦娟,李笑怡,蒋立文,黄海

关键词: 酸笋,广西,无盐发酵,高通量测序技术,细菌多样性

来源: 中国酿造 2019年07期

年度: 2019

分类: 工程科技Ⅰ辑,基础科学

专业: 生物学,轻工业手工业

单位: 湖南农业大学食品科学技术学院,长沙市食品药品检验所,食品科学与生物技术湖南省重点实验室,柳州市美申园食品科技有限公司

基金: 长沙市科技局重点项目(Kq1801152),国家自然科学基金面上项目(31571819)

分类号: TS255.5;TS201.3

页码: 85-90

总页数: 6

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