寡聚酰胺丝组二肽缀合物论文_牛明玉

导读:本文包含了寡聚酰胺丝组二肽缀合物论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:聚酰胺,核酸,表征,化合物,试剂,规律,论文。

寡聚酰胺丝组二肽缀合物论文文献综述

牛明玉[1](2005)在《人工核酸酶—寡聚酰胺与丝组二肽缀合物的合成研究》一文中研究指出化学合成的DNA、RNA定位切割试剂是国际上80年代开始发展起来的一类新型的非酶断裂工具,被称为人工核酸酶或化学核酸酶。人工核酸酶是分子生物学及基因工程的重要工具,它可以作为研究核酸结构和功能方面的探针。因此开发出高效的人工核酸切割试剂,具有非常重要的理论意义和应用价值。人工核酸酶主要由识别试剂和切割试剂通过某种连接物缀合而成。 本论文设计合成出了寡聚酰胺/丝组二肽缀合物这样一类新型的人工核酸酶。它以单体N—甲基吡咯为原料,合成的寡聚酰胺作为该分子的核酸识别系统。同时,连接物(己二胺部分)与切割系统(丝组二肽部分)的组氨酸残基C端相连,这样就可以保证切割活性基团一丝氨酸残基上氨基和侧链羟基的相对位置。实验主要用到了DCC/HOBt偶合反应,Chloroform反应,Pd-C催化氢化反应,该系列的合成反应条件温和,反应时间短,除少数步骤产率较低外,大部分收率较高。 我们利用氢谱、碳谱、红外光谱、电喷雾质谱、高分辨质谱及多种二维核磁共振谱等分析手段对化合物结构进行了详细的表征,并从中总结出了一些规律,这对以后判别此类化合物提供了参考。例如,利用~1H NMR可以很方便的判断化合物中含有几个N—甲基吡咯环,利用电喷雾质谱可从化合物的断裂途径判断出各个基团的连接顺序。 同时为了保证合成的化合物在生物活性测试时的纯度,我们利用高效液相与质谱联机方式(HPLC—ESI—MS)对多步合成的寡聚酰胺/丝组二肽缀合物进行分析。与清华大学合作,初步实验发现合成的多聚酰胺/丝组二肽缀合物对DNA的切割活性高出丝组二肽数百倍。(本文来源于《郑州大学》期刊2005-05-20)

杨晓丽[2](2004)在《寡聚酰胺-丝组二肽缀合物的设计合成、质谱解析及其切割DNA活性研究》一文中研究指出核酸切割剂在核酸化学研究领域中有至关重要的作用。在DNA突变、癌变以及细胞死亡等研究领域,核酸切割剂是一个很好的分子生物学工具,更是设计基因药物的模版。基于丝组二肽对DNA的切割活性和聚酰胺的特异性识别功能,本论文主要研究了寡聚酰胺-丝组二肽缀合物(NO_2-PyPyIm-SerHis)的设计合成、质谱解析及其切割DNA活性研究。 1.通过卤仿反应和DCC/HOBt偶合反应合成酰胺键,首次合成了寡聚酰胺-丝组二肽缀合物。该合成路线反应条件温和,产率适中。在目标分子的合成设计中,由寡聚酰胺作为该分子的DNA识别片断(DNA-BindingMotif,DBM),同时,柔性链(Linker Motif,LM)与活性片断(Active Motif,AM)Ser-His的组氨酸残基C端相连,保证切割活性基团-丝氨酸残基上氨基和侧链羟基的状态和相对位置。生物活性实验验证此设计是合理的。 2.利用高分辨质谱、红外光谱、核磁共振谱(~1H NMR和~(13)C NMR)和电喷雾质谱(ESI-MS和ESI-MS/MS)分析鉴定化合物的结构,并分析总结了其质谱裂解规律。 3.在电喷雾质谱研究过程中,首次发现:质谱裂解过程中产生的某些酰胺类碎片离子和酯类化合物在离子阱中容易发生水解现象,并利用分子内的氨基催化分子离子水解反应的原理对此不常见的特征性裂解进行了详细解释。这可为同类酰胺或酯的质谱裂解规律和结构解析提供快捷、准确的依据。 4.论文首次提出在电喷雾质谱的裂解过程中,分子离子/碎片离子经过四元环、五元环和六元环过渡态发生氢重排,失去一个较为稳定的中性分子,趋于生成共轭体系的碎片离子。而当分子有羟基存在时容易发生酰胺键脱水现象。 5.利用紫外光谱和琼脂糖凝胶电泳两种方法测定了在B-R和Tri-HCl缓冲溶液中寡聚酰胺-丝组二肽缀合物与DNA的相互作用。发现Tri-HCl抑摘要 制目标分子切割DNA。两种方法得到的实验结论是相吻合的。虽然我们 没有观察到寡聚酞胺一丝组二肤缀合物特异性地切割DNA,但琼脂糖凝 胶电泳图谱证明我们所合成的寡聚酞胺一丝组二肤缀合物 (N 02一PyPylm一serHis)切割DNA的活性明显高于丝组二肤。这可归因 于识别片断·(DBM)寡聚酞胺的存在增加了活性片断(AM)Se卜His的 局部浓度,相应地提高了活性片断(AM)丝组二肤切割DNA的活性。 寡聚酞胺一丝组二肤缀合物(N仇一PyPylm一serHis)是一个高效全新的DNA切割剂,同时具有发展成为抗肿瘤前药的潜力。为设计合成更有效的特异性切割DNA化合物,提供了理论和实践基础。(本文来源于《郑州大学》期刊2004-03-28)

寡聚酰胺丝组二肽缀合物论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

核酸切割剂在核酸化学研究领域中有至关重要的作用。在DNA突变、癌变以及细胞死亡等研究领域,核酸切割剂是一个很好的分子生物学工具,更是设计基因药物的模版。基于丝组二肽对DNA的切割活性和聚酰胺的特异性识别功能,本论文主要研究了寡聚酰胺-丝组二肽缀合物(NO_2-PyPyIm-SerHis)的设计合成、质谱解析及其切割DNA活性研究。 1.通过卤仿反应和DCC/HOBt偶合反应合成酰胺键,首次合成了寡聚酰胺-丝组二肽缀合物。该合成路线反应条件温和,产率适中。在目标分子的合成设计中,由寡聚酰胺作为该分子的DNA识别片断(DNA-BindingMotif,DBM),同时,柔性链(Linker Motif,LM)与活性片断(Active Motif,AM)Ser-His的组氨酸残基C端相连,保证切割活性基团-丝氨酸残基上氨基和侧链羟基的状态和相对位置。生物活性实验验证此设计是合理的。 2.利用高分辨质谱、红外光谱、核磁共振谱(~1H NMR和~(13)C NMR)和电喷雾质谱(ESI-MS和ESI-MS/MS)分析鉴定化合物的结构,并分析总结了其质谱裂解规律。 3.在电喷雾质谱研究过程中,首次发现:质谱裂解过程中产生的某些酰胺类碎片离子和酯类化合物在离子阱中容易发生水解现象,并利用分子内的氨基催化分子离子水解反应的原理对此不常见的特征性裂解进行了详细解释。这可为同类酰胺或酯的质谱裂解规律和结构解析提供快捷、准确的依据。 4.论文首次提出在电喷雾质谱的裂解过程中,分子离子/碎片离子经过四元环、五元环和六元环过渡态发生氢重排,失去一个较为稳定的中性分子,趋于生成共轭体系的碎片离子。而当分子有羟基存在时容易发生酰胺键脱水现象。 5.利用紫外光谱和琼脂糖凝胶电泳两种方法测定了在B-R和Tri-HCl缓冲溶液中寡聚酰胺-丝组二肽缀合物与DNA的相互作用。发现Tri-HCl抑摘要 制目标分子切割DNA。两种方法得到的实验结论是相吻合的。虽然我们 没有观察到寡聚酞胺一丝组二肤缀合物特异性地切割DNA,但琼脂糖凝 胶电泳图谱证明我们所合成的寡聚酞胺一丝组二肤缀合物 (N 02一PyPylm一serHis)切割DNA的活性明显高于丝组二肤。这可归因 于识别片断·(DBM)寡聚酞胺的存在增加了活性片断(AM)Se卜His的 局部浓度,相应地提高了活性片断(AM)丝组二肤切割DNA的活性。 寡聚酞胺一丝组二肤缀合物(N仇一PyPylm一serHis)是一个高效全新的DNA切割剂,同时具有发展成为抗肿瘤前药的潜力。为设计合成更有效的特异性切割DNA化合物,提供了理论和实践基础。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

寡聚酰胺丝组二肽缀合物论文参考文献

[1].牛明玉.人工核酸酶—寡聚酰胺与丝组二肽缀合物的合成研究[D].郑州大学.2005

[2].杨晓丽.寡聚酰胺-丝组二肽缀合物的设计合成、质谱解析及其切割DNA活性研究[D].郑州大学.2004

论文知识图

一6化和物a和bDNA的活性对照电泳图谱一7化合物b和se卜His切割DNA的活性对照...一5Ps切割人一DNA的琼脂糖凝胶电泳一1固相法合成巧flm多?一6人工调节因子代表性的DBDs和RDs和Li...

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