青岛百合花发育E类基因LtSEP3的克隆及表达分析

论文摘要

为研究青岛百合花发育问题的分子调控机理,以青岛百合花朵为材料,克隆得到一个MADS-box家族E类基因SEPALLATA3（SEP3）,命名为LtSEP3,开放阅读框为687bp,预测编码228个氨基酸。生物信息学分析结果表明,LtSEP3蛋白的相对分子质量为26 179.58D,理论等电点在8.68,不稳定系数为33.66,属于稳定蛋白,总平均亲水性（GRAVY）为-0.819,脂肪系数为79.96。氨基酸序列比对显示,LtSEP3基因编码的蛋白具有典型的MADS结构域和K-box区。LtSEP3与同为百合属植物的岷江百合的MADS蛋白的氨基酸序列亲缘关系最近;qRT-PCR分析显示,LtSEP3具有组织表达特异性,主要在花中表达,在鳞茎、茎、叶中几乎不表达,在花朵开放的中后期,LtSEP3表达量达到峰值。本研究认为,LtSEP3基因可能在青岛百合花朵开放和花发育过程中具有重要作用。

论文目录

• 1 材料与方法
•   1.1 试验材料
•   1.2 青岛百合总RNA的提取及LtSEP3基因克隆
•   1.3 LtSEP3蛋白生物信息学分析
•   1.4 实时荧光定量PCR分析
• 2 结果与分析
•   2.1 LtSEP3的克隆
•   2.2 LtSEP3基因进化关系分析
•   2.3 青岛百合LtSEP3蛋白序列分析
•   2.4 实时荧光定量PCR表达分析
• 3 讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 于佳玉,朱梦瑶,许丽,刘志君,吕文秀,李伟,王奎玲

关键词: 青岛百合,花发育,转录因子,克隆

来源: 青岛农业大学学报(自然科学版) 2019年04期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,园艺

单位: 青岛农业大学园林与林学院/园林植物种质创新与利用实验室

基金: 国家级大学生创新训练项目(201710435021)

分类号: Q943.2;S682.29

页码: 280-285+291

总页数: 7

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