导读:本文包含了比较基因组论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因组,基因组学,霍尔,陆地棉,叶斑病,海岛,叶绿体。
比较基因组论文文献综述
马东阳,于莉莉,刘贵峰[1]（2019）在《微阵列比较基因组杂交技术的研究进展》一文中研究指出微阵列比较基因组杂交不仅有快速自动化,同时有高通量、高灵敏度及高分辨率等优点,可以精准地对微缺失和微重复等基因组变异进行检测,为先天性疾病、肿瘤患者以及产前诊断中脱氧核糖核酸拷贝数变化的提供了一种切实可行的检测方法。本文对该技术的基本原理、特点、芯片的探针类型和结果分析分别进行了介绍,着重综述了在肿瘤、先天性疾病和产前诊断等领域的临床应用,为其在科研或临床上更广泛的应用提供新的思路。(本文来源于《海南医学》期刊2019年23期）
钟杰,李利,宋天增,张红平,郭家中[2]（2019）在《比较基因组学分析鉴定影响藏山羊耳朵大小的遗传位点》一文中研究指出耳型是山羊的一个品种标准性状,但有关山羊耳型变异的遗传机制尚不清楚。利用来自西藏自治区仲巴县的正常耳和小耳藏山羊群体及前期测定的5个山羊群体的基因组序列,采用比较基因组学鉴定影响山羊耳朵大小的遗传位点。100 kb窗口大小和25 kb步长滑动窗口的全基因组F_(ST)以及H_P比值的结果显示,2号染色体56.475～56.575 Mb基因组区域在两种耳型藏山羊之间分化程度最高(F_(ST)=0.36)。在该窗口内,30个SNPs位点的等位基因频率差异较大(△AF>0.5),特别是其中1个SNP位点(chr2:56559507,C>T)的△AF高达0.87。在7号染色体45.05～59.76 Mb区域内,受选择基因数量多达52个。对离异值窗口包含的372个基因进行富集分析, SPINK5、 TCOF1、PPARD等基因显着富集在10个与哺乳动物耳朵发育相关的表型条目中;特别是 SPINK5基因上游5kb处2个SNPs(c.-4283A>G、c.-4295G>A)的等位基因频率差异高达0.9和0.83。主成分分析结果表明,仲巴地区藏山羊的遗传组成与低海拔地方山羊品种更接近;而措勤地区藏山羊的遗传组成与其他山羊品种区别较大。初步鉴定到与藏山羊耳型变异相关的基因组区域,为深入研究山羊耳朵发育的分子机制提供依据;并揭示出不同地区藏山羊群体遗传组成存在较大差异。(本文来源于《西北农业学报》期刊2019年11期）
黎晓英,李俊威,刘胜贵,田玉桥,陈叁春[3]（2019）在《天麻基因组DNA不同提取方法比较》一文中研究指出以天麻块茎为供试材料,采用琼脂糖凝胶电泳检测和紫外分光光度含量测定技术,比较改良CTAB法和SDS-CTAB法提取天麻块茎基因组DNA的效果。结果表明,改良CTAB法提取天麻块茎基因组DNA的产量高于SDS-CTAB法,纯度略次于SDS-CTAB法,二者提取的基因组DNA,DNA结构完整、大片段的DNA分子含量高。该研究为天麻基因组DNA提取方法的选择提供了参考依据,为天麻种质资源的分子遗传研究奠定了一定的科学与技术基础。(本文来源于《安徽农业科学》期刊2019年22期）
闫慧清,张帅,敖选真,罗庆华[4]（2019）在《芒果和刺梨果实基因组DNA提取方法的比较研究》一文中研究指出刺梨和芒果是近几年贵州省经济发展的主要园艺产品,由于两者果实具有多糖、多酚含量高等特性,不利于产品优良品种的选育(获得高浓度和纯度的DNA是开展该产品分子实验的先决条件)。为此,本实验随机选择了‘台农’、‘金煌芒’2个芒果品种和‘贵农5号’、‘金刺梨’2个刺梨品种的果实为试验材料,分别通过TaKaRa试剂盒法,改进CTAB法和改进SDS法3种提取方法对其的DNA进行凝胶电泳检测和OD_(260/280)的比较分析。结果显示:改进CTAB提取出的DNA浓度较高,OD_(260/280)在1.83～1.91之间,纯度较高。改进SDS法其次,TaKaRa试剂盒法为最后。结论:改良CTAB是适合芒果和刺梨果实基因组DNA提取的最佳方法,该方法能有效去除果实DNA中的多糖和多酚,可获得高浓度和纯度的DNA。(本文来源于《贵州师范大学学报(自然科学版)》期刊2019年06期）
方磊,胡艳,陈杰丹,张志远,马卫[5]（2019）在《陆地棉和海岛棉比较基因组分析与优异性状形成的分子机制》一文中研究指出棉花纤维是重要的天然纺织纤维,在国民经济中占据着重要地位。二倍体棉花通过种间杂交加倍形成四倍体棉花祖先种,经长期的自然与人工选择,形成了目前世界广泛种植的栽培种即海岛棉和陆地棉。陆地棉占总面积的90%以上,产量高,纤维品质一般,被用来生产世界上大部分的服装。海岛棉占5～8%,纤维品质优异,主要用以生产高端奢侈品牌服装的高档棉织物。我们通过陆地棉半野生种、栽培种和海岛(本文来源于《2019年中国作物学会学术年会论文摘要集》期刊2019-10-27）
梅磊,肖钦之,陈进红,祝水金[6]（2019）在《3个棉属中植物络合素合酶的比较基因组学鉴定与功能预测》一文中研究指出【研究背景】重金属胁迫对植物的生长发育有不良影响,植物络合素合酶(Phytochelatin Synthase,PCS)在植物主动防御金属毒害过程中起关键作用,棉花对多种重金属有着较好的耐性,且种属数量多,属间差异大,是挖掘优质PCS功能基因的潜在对象;【材料与方法】为了更好的了解棉花中PCS基因的数量、分布及可能特性,以完成全基因组测序的3个代表性棉属陆地棉(Gossypium hirsutum,(AD)1)、雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii,D5)和亚洲棉(Gossypium arboreum,A2)为研究对象,结合双子叶模式植物拟南芥PCS蛋白特征域结构,鉴定3个棉花品系中PCS基因家族成员,并对其进行蛋白特征鉴定、同源类别分析、基因结构预测、酶作用位点比对以及半胱氨酸(Cys,Cysteine)分布分析;【结果与分析】主要结果表明:(1)在雷蒙德氏棉、亚洲棉和陆地棉中分别鉴定出2、2和4个PCS基因,棉花中所有PCS蛋白家族成员均含有2个特有的结构域,与催化中心相关的氨基酸位点完全保守;(2)PCS蛋白家族在进化上分属两个不同亚组,亚组(Ⅰ)与亚组(Ⅱ)在亲缘关系上分别更接近双子叶植物和线虫,两个亚组内PCS家族在基因结构,Cys分布的表现上也出现差异化,依据这些推测亚组(Ⅰ)相较亚组(Ⅱ)可能会表现出更强的植物络合素合酶活性;(3)雷蒙德氏棉中的两个旁系同源基因外显子完整性不及亚洲棉和陆地棉,可能对重金属更敏感;【结论】棉属PCS基因功能分化程度要高于其他植物,对棉属PCS进行深入研究意义重大。(本文来源于《2019年中国作物学会学术年会论文摘要集》期刊2019-10-27）
唐庆华,覃伟权,于少帅,宋薇薇,余凤玉[7]（2019）在《槟榔细菌性叶斑病菌全基因组测序及比较基因组学分析》一文中研究指出由须芒草伯克霍尔德氏菌(Burkholderia andropogonis)侵染引起的槟榔细菌性叶斑病是槟榔生产上最严重的细菌性病害之一。对代表性菌株Y30 (中国典型培养物保藏中心编号:CCTCC AB2014035)进行了初步测序,通过Illumina Hiseq 2000平台测序,Y30共产生1 207 Mb数据。基于测序数据组装获得的Y30基因组大小为7 075 563bp,GC含量58.67%,共33个scaffold,155个contig。通过基因预测、重复序列预测、非编码RNA预测等方法获取Y30基因组的组成情况。Y30的基因组含有7 081个基因,总长度为6 231 444bp,平均长度880bp,占基因组全长的88.07%。串联重复序列共120个,总长为19 152bp,占基因组全长的0.27%。小卫星序列49个,微卫星序列38个。tRNA 58个,rRNA 12个。将菌株Y30与其他Burkholderia全基因组序列进行了共线性分析,结果显示Y30菌株与B.cenocepacia菌株J 2315和B.xenovorans菌株LB400全基因组核酸共线性最高。用Glimmer3.0软件对Y30基因组的ORF进行预测,获得7 081个编码基因,依据COG分类标准将7 081个基因划分为22类。通过与KEGG数据库进行比对,Y30的7 081个基因可划分为34类。(本文来源于《中国植物保护学会2019年学术年会论文集》期刊2019-10-23）
赵志常,高爱平,黄建峰,罗睿雄[8]（2019）在《腰果、荔枝、杧果和番石榴叶绿体基因组的比较分析》一文中研究指出利用叶绿体基因组学分析方法,对腰果、荔枝、杧果和番石榴4种热带果树的叶绿体全基因组进行了比较分析。腰果叶绿体全基因组为172 199 bp,反向重复区(IRA和IRB)32 713 bp、小单拷贝区(SSC)19 046 bp、大单拷贝区(LSC)87 727 bp,其叶绿体基因组含有150个基因,包括87个编码蛋白质基因、30个tRNA基因和4个r RNA基因。荔枝叶绿体全基因组长度162 524 bp,大单拷贝区(LSC)85 750 bp、小单拷贝区(SSC)16 568 bp、反向重复区(IRA和IRB)30 103 bp,其叶绿体基因组含有121个基因,包括87个编码蛋白质基因、30个tRNA基因和4个r RNA基因。杧果叶绿体全基因组长度157 780 bp,反向重复区(IRA和IRB)40 428 bp、小单拷贝区(SSC)43 323 bp、大单拷贝区(LSC)59 717 bp,其叶绿体基因组含有171个基因,包括118个编码蛋白质基因、45个tRNA基因和8个rRNA基因。番石榴叶绿体全基因组长度158 896 bp,大单拷贝区(LSC)87 693 bp、小单拷贝区(SSC)18 465 bp、向重复区(IRA和IRB)26 369 bp,其叶绿体基因组含有113个基因,包括79个编码蛋白质基因、30个tRNA基因和4个r RNA基因。对41种园艺植物的叶绿体基因组分析发现,同科不同属、同属不同种的更容易聚为一类。研究结果丰富了4种热带果树的叶绿体方面的遗传信息,为热带果树的种质资源评价、分子标记育种、种质资源遗传多样性和群体谱系关系等方面的研究奠定了理论基础,同时也为热带果树的系统进化分析提供了数据支持。(本文来源于《中国园艺学会2019年学术年会暨成立90周年纪念大会论文摘要集》期刊2019-10-21）
刘亚铭,陈高,秦松,崔玉琳,崔红利[9]（2019）在《真核微藻糖转运蛋白基因的比较基因组学分析》一文中研究指出糖转运蛋白是一种位于细胞膜上的重要载体蛋白,负责将胞外的糖类物质转运至细胞内供细胞代谢利用,除了转运功能外,糖转运蛋白还可以作为糖传感器在真核微藻、哺乳动物和高等植物中发挥重要作用。以真核微藻基因组数据为基础,在基因组水平对糖转运蛋白基因的分布、结构和进化规律进行了系统的研究。对测序完成的28株真核微藻糖转运蛋白家族进行了比较基因组学分析,从中发现了70个假定的糖转运蛋白序列,即为9个HUP1,39个HUP2和22个HUP3类型的糖转运蛋白基因。初步推断真核微藻的糖转运蛋白基因是细菌起源的。建立了微藻糖转运蛋白基因-结构-功能的框架结构,对之后构建优良藻株具有重要的理论和现实意义。(本文来源于《生物学杂志》期刊2019年05期）
冯鉴童[10]（2019）在《蛋螺属（腹足纲：蛋螺亚纲：蛋螺科）线粒体全基因组序列比较及系统发育分析》一文中研究指出为了更好地了解蛋螺的线粒体基因组,我们对中国的4种蛋螺渔舟蛋螺(15427 bp)、齿纹蛋螺(15552 bp)、黑线蛋螺(15571 bp)、波纹蛋螺(15583 bp)的线粒体全基因组进行了比较分析研究。为了确定蛋螺属海生腹足类在系统发育中的地位,我们构建了基于13个蛋白质编码基因的系统发育树。这项研究有助于了解比较蛋螺科的线粒体基因组和蛋螺科的系统发育关系。(本文来源于《第叁届现代海洋（淡水）牧场学术研讨会摘要集》期刊2019-10-17）
比较基因组论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
耳型是山羊的一个品种标准性状,但有关山羊耳型变异的遗传机制尚不清楚。利用来自西藏自治区仲巴县的正常耳和小耳藏山羊群体及前期测定的5个山羊群体的基因组序列,采用比较基因组学鉴定影响山羊耳朵大小的遗传位点。100 kb窗口大小和25 kb步长滑动窗口的全基因组F_(ST)以及H_P比值的结果显示,2号染色体56.475～56.575 Mb基因组区域在两种耳型藏山羊之间分化程度最高(F_(ST)=0.36)。在该窗口内,30个SNPs位点的等位基因频率差异较大(△AF>0.5),特别是其中1个SNP位点(chr2:56559507,C>T)的△AF高达0.87。在7号染色体45.05～59.76 Mb区域内,受选择基因数量多达52个。对离异值窗口包含的372个基因进行富集分析, SPINK5、 TCOF1、PPARD等基因显着富集在10个与哺乳动物耳朵发育相关的表型条目中;特别是 SPINK5基因上游5kb处2个SNPs(c.-4283A>G、c.-4295G>A)的等位基因频率差异高达0.9和0.83。主成分分析结果表明,仲巴地区藏山羊的遗传组成与低海拔地方山羊品种更接近;而措勤地区藏山羊的遗传组成与其他山羊品种区别较大。初步鉴定到与藏山羊耳型变异相关的基因组区域,为深入研究山羊耳朵发育的分子机制提供依据;并揭示出不同地区藏山羊群体遗传组成存在较大差异。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
比较基因组论文参考文献
[1].马东阳,于莉莉,刘贵峰.微阵列比较基因组杂交技术的研究进展[J].海南医学.2019
[2].钟杰,李利,宋天增,张红平,郭家中.比较基因组学分析鉴定影响藏山羊耳朵大小的遗传位点[J].西北农业学报.2019
[3].黎晓英,李俊威,刘胜贵,田玉桥,陈叁春.天麻基因组DNA不同提取方法比较[J].安徽农业科学.2019
[4].闫慧清,张帅,敖选真,罗庆华.芒果和刺梨果实基因组DNA提取方法的比较研究[J].贵州师范大学学报(自然科学版).2019
[5].方磊,胡艳,陈杰丹,张志远,马卫.陆地棉和海岛棉比较基因组分析与优异性状形成的分子机制[C].2019年中国作物学会学术年会论文摘要集.2019
[6].梅磊,肖钦之,陈进红,祝水金.3个棉属中植物络合素合酶的比较基因组学鉴定与功能预测[C].2019年中国作物学会学术年会论文摘要集.2019
[7].唐庆华,覃伟权,于少帅,宋薇薇,余凤玉.槟榔细菌性叶斑病菌全基因组测序及比较基因组学分析[C].中国植物保护学会2019年学术年会论文集.2019
[8].赵志常,高爱平,黄建峰,罗睿雄.腰果、荔枝、杧果和番石榴叶绿体基因组的比较分析[C].中国园艺学会2019年学术年会暨成立90周年纪念大会论文摘要集.2019
[9].刘亚铭,陈高,秦松,崔玉琳,崔红利.真核微藻糖转运蛋白基因的比较基因组学分析[J].生物学杂志.2019
[10].冯鉴童.蛋螺属（腹足纲：蛋螺亚纲：蛋螺科）线粒体全基因组序列比较及系统发育分析[C].第叁届现代海洋（淡水）牧场学术研讨会摘要集.2019
论文知识图
