染色体失活论文_徐思琦

导读:本文包含了染色体失活论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:染色体,胚胎,干细胞,联苯,基因,肉芽肿,家系。

染色体失活论文文献综述

徐思琦[1](2019)在《基于叁联体家庭数据X染色体偏倚失活的统计度量研究》一文中研究指出背景:X染色体失活(X chromosome inactivation,XCI)是调控女性X染色体基因表达水平的重要机制。XCI发生在女性胚胎发育的早期,此时女性的两条X染色体中,只有一条X染色体上的基因会被表达,而另一条X染色体上的基因则会发生表达沉默。由于女性有两条X染色体而男性只有一条,因此XCI机制的存在使得男、女性之间的X染色体基因表达水平接近一致(又称剂量补偿)。XCI的选择一般是随机的,即女性两条X染色体发生失活的可能性相等。但目前已有大量研究发现,非随机的XCI现象(偏倚失活)也存在于女性中,并与许多人类疾病的发生发展密切相关。然而,目前XCI偏倚程度的检测主要依赖于分子生物学的方法,而且尚未存在统计学方法能够从群体遗传学的角度利用家庭数据度量XCI的偏倚程度。目的:(1)基于叁联体家庭数据,提出可用于度量XCI偏倚程度的统计指标,并构造该统计指标的点估计与区间估计;(2)研究叁联体家庭中父母基因型数据缺失时的参数估计方法;(3)将所提出的方法运用于北美类风湿性关节炎疾病数据中,以对该方法做进一步的实例验证,并探索与类风湿性关节炎相关的偏倚失活位点。方法:本文提出一种基于叁联体家庭数据的统计学指标用以度量XCI偏倚程度。该统计度量指标可以表示为女性的两个基因型相对危险度构成的比值,其点估计通过最大似然估计方法获得。当叁联体家庭中的父母基因型缺失时,采用条件期望最大化算法(expectation-conditional-maximization algorithm,ECM)计算未知参数的最大似然估计值。进一步,基于似然比检验方法得到该比值的置信区间。通过计算机模拟,研究该统计指标的点估计与区间估计的统计性质。最后,将该方法应用于北美类风湿性关节炎疾病数据进行实例验证。结果:模拟结果显示,在各种模拟背景下,该统计量的置信区间的覆盖率均接近预设值,并且相应的似然比检验随着该统计量的真实值与原假设取值之间距离的增大而具有更高的检验效能。该统计量点估计的中位数与真实值之间的差距在一定程度上受到数据的缺失模式与基因型相对危险度的影响。另外,将本方法应用于北美类风湿性关节炎疾病数据时,发现存在偏倚失活的可疑位点rs2238907,但该结论仍需要通过生物学方法做进一步验证。结论:本文提出了XCI偏倚程度的统计度量指标,并且构造出该统计指标的点估计与置信区间。该方法既适用于完整的叁联体家庭数据,也适用于父母基因型缺失的叁联体家庭数据,能够有效地反映群体XCI偏倚程度。因此,值得将该方法推荐应用于真实数据分析,以探索存在偏倚失活的位点。(本文来源于《南方医科大学》期刊2019-05-28)

傅洪端,胡雪峰[2](2019)在《探究花斑猫背后的X染色体失活》一文中研究指出X染色体失活是表观遗传学的一种特殊现象。本文以花斑猫为例,对X染色体失活的机制和相关异常进行了简要介绍。(本文来源于《生物学教学》期刊2019年05期)

王诗语,蒋利萍,赵晓东[3](2019)在《X染色体失活致女性X连锁慢性肉芽肿病》一文中研究指出目的通过对1例罕见婴幼儿女性X连锁慢性肉肿病(X-CGD)患儿临床及产前产后CYBB基因特征的分析,丰富对该病的认识,并对该病的产前诊断予以警示。方法流式细胞术检测患儿及其父母中性粒细胞呼吸爆发功能及gp91phox蛋白表达情况;PCR直接测序法分析CYBB基因;患儿及父母DNA经酶切后,采用荧光标记PCR扩增,产物用毛细管电泳法检测计算X染色体失活程度。结果患儿,女,2个孪生哥哥均为X-CGD患者,母亲为突变基因携带者。曾行胎儿羊水细胞DNA分析,显示为CYBB exon9 c.1123delG杂合突变,是女性携带者。2月龄时,以肛周脓肿为首发症状,外周血中性粒细胞呼吸爆发功能明显异常,SI=0.65,NBT=0%;gp91phox蛋白无表达。患儿外周血细胞cDNA测序结果显示CYBB exon9 c.1123delG纯合缺失突变。X染色体失活检测,患儿失活率99.5%,其母亲失活率76.1%。结论由于女性携带者有出现正常X染色体失活的可能性,所以产前诊断时,要对胎儿的DNA及cDNA均进行分析,且应对女性CYBB基因杂合突变胎儿行脐带血中性粒细胞呼吸爆发功能检查明确是否为女性患者。(本文来源于《免疫学杂志》期刊2019年05期)

谢玉欢,张慧敏,李浩贤,刘维强,孙筱放[4](2018)在《全外显子测序分析X染色体不同失活状态人胚胎干细胞遗传差异》一文中研究指出目的在全外显子DNA序列水平上分析X染色体异常失活与随机失活的人胚胎干细胞(hESC)在各种变异类型上的数量,比较两种不同失活模式细胞变异水平的差异。方法 10株人胚胎干细胞根据其X染色体失活(XCI)状态分为异常XCI组和随机XCI组。运用全外显子测序技术对干细胞进行DNA水平变异分析。对两组细胞总变异数、单核苷酸变异、微小插入、缺失变异、移码变异、无义突变、错义突变等数量进行统计分析,比较两种不同失活模式细胞间各变异是否有差异。结果两组细胞间均检出超过2万个变异,在变异总数量上两组间差异无统计学意义(P>0.05);在X染色体上两组变异均以错义突变和同义突变为主,对可导致蛋白编码错误的移码突变和无义突变,异常XCI组和随机XCI组各检出5.4个,两组间差异无统计学意义(P>0.05);对可导致蛋白编码改变的变异,在异常XCI组特异性地检出TCEAL6、UBE2NL、FTHL17叁个基因变异,其功能主要与RNAⅡ型聚合酶启动子在基因转录调控及翻译的延伸作用及复制后的修复和相关蛋白的泛素化作用有关。结论在异常失活hESC和随机失活hESC两组细胞间并无明显的DNA序列变异差异。全外显子测序技术可以为在高分辨率水平上分析hESC遗传性状提供极好的技术支持。(本文来源于《广东医学》期刊2018年16期)

汪鹏[5](2018)在《X染色体失活的统计度量及合并X染色体失活的关联分析研究》一文中研究指出背景:X染色体失活(X chromosome inactivation,XCI)是指在胚胎发育早期女性的两条X染色体中的一条发生失活的现象。由于男性只有一条X染色体,所以XCI也被视为一种剂量补偿的机制。XCI 一般被认为是随机的。但是偏倚失活现象在正常人群和患病人群中均有文献报导。目前偏倚失活的检测主要依赖于分子遗传学的方法,尚未有统计学指标从群体遗传学上去度量失活的程度。关联分析是一种检验性状值和标记位点之间是否存在关联的统计学方法,主要用来定位疾病位点的位置。人类通过全基因组关联分析发现了很多和疾病相关联的位点,但是其中只有很少的一部分来自X染色体。目前已经有一些X染色体上关联分析的方法,其中一些并没有合并XCI的信息,另外有一些需要假设 Hardy-Weinberg 平衡律(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)成立。然而,目前尚未有合并XCI信息又不依赖于HWE假设的统计学方法。目的:(1)基于病例对照设计,从群体遗传学角度提出一种可以度量X染色体失活程度的统计指标,并构造出相应的点估计和区间估计;(2)基于病例对照设计,提出一种可以合并不同剂量补偿模式又不依赖于HWE假设的X染色体关联分析方法。(3)将新提出的方法运用到Graves疾病数据进行实例验证。方法:(1)因为偏倚失活和男性无关,所以单独选取女性的病例对照数据。在致病基因的效应具有可加性的假设下,经过简单的重参数化,提出用两个logistic回归的系数之比来度量X染色体失活的程度。基于新的统计指标,进一步提出用比值估计来构造点估计,用delta法和似然比(Likelihood Ratio,LR)的方法来构造相应的置信区间,并通过计算机模拟研究来比较delta法和LR法的覆盖率和尾端不覆盖率。(2)考虑到男性的数据为半合子,所以采用基于等位基因频率的关联分析方法,并在不同的剂量补偿模式下给予女性和男性不同的权重,然后加权合并。在Hardy-Weinberg不平衡律下,估计加权统计量的方差。选用完全剂量补偿下和没有剂量补偿下的统计量的最大值来构造检验统计量Zmax,并用菱形公式法和数值法估计相应的P值。通过计算机模拟研究对新提出的方法Zmax和现有的Xcat方法以及Clayton方法(TA和TAD)的第一类错误率和检验效能进行比较。结果:(1)在所有模拟参数下,LR法的覆盖率都接近于预设值。而delta法在某些情况下会高估覆盖率而在另一些情况下会低估覆盖率。另外,delta法的左、右尾端不覆盖率在所有情况下都不均衡;而LR法的左、右尾端不覆盖率在女性等位基因频率为0.1时不均衡,但是在0.3时,左、右尾端不覆盖率变得均衡。(2)从第一类错误上看,Zmax方法在所有模拟背景下的第一类错误率都接近预设水平;Xcat方法在病例组与对照组的近交系数相同时,也可以很好地控制第一类错误率,否则第一类错误率会增大;TA和TAD在男性和女性的等位基因频率相等时也可以保持正确的第一类错误率,否则第一类错误率也可能会严重膨胀。从检验效能上看,Zmax方法的检验效能比Xcat方法和TAD方法都要高;Zmax方法在某些情况下检验效能高于TA方法,某些情况下很接近,而在另一些情况下低于TA方法。(3)实例分析的结果验证了新提出方法的可靠性和有效性。结论:(1)该论文从群体遗传学角度提出了一种度量X染色体失活程度的统计指标,并构造出相应的点估计和区间估计,可以用于筛选偏倚失活的位点。另外,LR法比delta法具有更准确的覆盖率和更均衡的尾部不覆盖率。(2)该论文提出的Zmax方法是一种稳健的且可以合并不同剂量补偿模式的X染色体上的关联分析方法。Zmax方法不需要指定遗传模型也不依赖于HWE的假设,且允许病例组和对照组的近交系数不等。综合第一类错误率和检验效能来看,Zmax方法要优于现有的方法。(本文来源于《南方医科大学》期刊2018-05-10)

谢彦舒[6](2018)在《X染色体失活与DMD女性携带者临床表型关系的研究》一文中研究指出目的 应用甲基化内切酶酶切法检测Duchenne肌营养不良(Duchenne muscular dystrophy,DMD)女性携带者X染色体失活情况,分析X染色体失活情况与DMD女性携带者临床表型的关系,探索DMD女性携带者不同临床表型的可能机制。方法1.收集2011年9月至2017年8月于广西医科大学第一附属医院儿科就诊,经基因检测确诊的DMD患者及其携带基因突变的女性亲属的临床资料;根据肌酸激酶水平将女性携带者分为高肌酸激酶组和正常肌酸激酶组。2.提取先证者及女性携带者外周血淋巴细胞DNA并测量其浓度及纯度;所有病例的DNA标本先进行甲基化敏感性限制性内切酶HpaII酶切/非酶切处理,然后扩增HUMARA基因片段,2%琼脂糖凝胶电泳后于化学发光成像系统下观察,Image Lab软件进行图像分析酶切实验是否成功。3.Fam荧光标记引物PCR扩增酶切处理后DNA标本的HUMARA基因片段,应用ABI373自动测序仪进行毛细管电泳分离,荧光标记片段经Peak Scanner 2.0进行分析,辨别失活X染色体及其父/母来源,根据基因片段荧光峰值计算X染色体失活比例,≥80%即为倾斜性失活。4.应用SPSS 22.0软件进行处理,采用完全随机设计两样本秩和检验、Spearman等方法分析统计实验数据,比较DMD女性携带者父/母来源X染色体失活、高肌酸激酶组和正常肌酸激酶组的差异,分析肌酸激酶水平与X染色体失活比例的相关性。P<0.05为差异有统计学意义。结果1.本研究共纳入38个DMD家系,包括男性DMD先证者40例,携带DMD基因突变的女性携带者57例,其中表现为肌酸激酶高的DMD女性携带者为36例(63.2%),纳入高肌酸激酶组;表现为肌酸激酶正常的DMD女性携带者为21例(36.8%),纳入正常肌酸激酶组。高肌酸激酶组中肌酸激酶最高值为7012U/L,最低值为183U/L,平均值1072.4U/L。2.DMD先证者及女性携带者外周血DNA提取成功(浓度最高值125.8ng/ul,最低值21.1 ng/ul,纯度范围在1.63-2.1之间);所有标本酶切实验成功,即DMD先证者酶切组电泳结果为无条带,非酶切组出现一条清晰的条带,而DMD女性携带者酶切组和非酶切组均可见一条条带,且非酶切组条带浓度要高于酶切组。3.ABI373自动测序仪毛细管电泳结果显示DMD先证者酶切组无明显峰值,非酶切组显示有一个峰值。DMD女性携带者酶切组和非酶切组均显示有两个峰值,其中一个峰值所在片段大小与非酶切组DMD先证者一致。本研究57例DMD女性携带者中30例为母源X染色体失活(52.6%);27例为父源X染色体失活(47.4%)。4.比较DMD女性携带者母源X染色体失活组和父源X染色体失活组肌酸激酶水平,结果显示Z=-0.176,P=0.86>0.05,可见母源X染色体失活组和父源X染色体失活组的肌酸激酶水平差异不具有统计学意义。比较DMD女性携带者高肌酸激酶组和正常肌酸激酶组X染色体失活比例,结果显示Z=-0.24,P=0.81>0.05,可见高肌酸激酶组和正常肌酸激酶组的X染色体失活比例差异不具有统计学意义。分析X染色体失活比例与DMD女性携带者肌酸激酶水平的相关性,结果显示P=0.858>0.05,可见X染色体失活比例与DMD女性携带者肌酸激酶水平不存在相关性。结论1.本研究高肌酸激酶表现的DMD女性携带者占多数,然而不能单纯依靠肌酸激酶水平诊断DMD女性携带者身份,最终还是要依靠基因诊断明确遗传学身份。2.母源X染色体失活组和父源X染色体失活组的肌酸激酶水平无明显差异,高肌酸激酶组和正常肌酸激酶组DMD女性携带者的X染色体失活比例无明显差异,且血清肌酸激酶水平与X染色体失活比例无明显相关性,可见DMD女性携带者失活X染色体来源及X染色体失活比例可能不是造成DMD女性携带者临床表型不同的原因。(本文来源于《广西医科大学》期刊2018-05-01)

邹绮蕾[7](2017)在《X染色体印记效应检验及合并X染色体失活与印记效应的关联分析研究》一文中研究指出背景:关联分析(association analysis)是用来检验等位基因频率或基因型频率在两组个体(患病人群和正常人群)之间是否存在差异的方法。其主要目的是为了定位疾病位点,利用疾病位点和标记位点的关系来找到遗传变异。如果标记位点和疾病位点之间的距离很接近,它们可能存在连锁不平衡(linkage disequilibrium),那么这两个位点很有可能是共同遗传给后代的。如果在患病的人群中这个标记位点的频率比正常人群的高,利用关联分析方法就可能将该疾病位点进行定位。遗传印记效应(genomic imprinting)是我们熟知的一种病因学因素。遗传印记基因的表达取决于等位基因是来自父亲还是来自母亲,而这种现象可能会导致疾病和基因之间的关联。遗传印记现象会影响后代在子宫内的发育以及出生后个体的成长发育。与常染色体上变异的遗传印记作用有关的疾病有:Beckwith-Wiedemann 综合征、Prader-Will 综合征、Angelman 综合征、糖尿病和精神分裂症等。另外,X染色体上的印记基因在复杂疾病和性状的形成上也许起到了关键的作用,如Turner综合征和孤独症等。目前已经有很多方法可以用来检验基于核心家庭和一般家系常染色体上的遗传印记效应。有关X染色体上印记效应的检验,仅仅有最近新提出的基于核心家庭数据的X染色体质量性状位点上的亲代不对称检验方法(parental-asymmetry test on X chromosome,XPAT)。然而该方法并不适用于一般的家系数据。X 染色体失活(X chromosome inactivation,XCI)是一种剂量补偿(dose compensation)的机制,通常发生在胚胎发育早期,女性的两条X染色体中的一条发生了失活现象,从而导致女性个体的每一个细胞中,只有一条来自父亲或者母亲的染色体表达。通常,这种X染色体失活的现象是随机的,即女性的两条X染色体失活的比例是50%:50%。但是,如果失活现象不是随机的,那就称之为偏倚失活(skewed X chromosome inactivation)。偏倚失活通常意味着有75%或以上的细胞失活同一条X染色体,而另外25%的细胞失活另一条X染色体。另外,跟常染色体一样,X染色体还存在着一种特殊现象就是逃逸失活(escape from X chromosome inactivation)的情况,即两条X染色体均表达,没有失活。在一些女性个体中的某一条X染色体上,大概有四分之叁的基因是沉默了的,其余四分之一的基因属于逃逸失活区域。然而,现有的X染色体上的关联分析方法中,仅考虑了 X染色体失活,并没有合并遗传印记的效应。因此,本文的研究目的主要有以下两点:(1)基于家系数据,提出X染色体质量性状位点上遗传印记效应检验方法;(2)基于两代人的病例对照数据,提出同时合并X染色体失活和印记效应的关联分析方法。方法:(1)考虑X染色体上的位点,参考常染色体上的PPAT方法,利用家系中所有有信息的核心家庭,当感兴趣的SNP位点与疾病之间存在关联的情况下,提出基于家系数据的X染色体亲代不对称检验方法(pedigree parental-asymmetry test on X chromosome,XPPAT)。当某些家系中存在缺失基因型个体时,我们根据观察到的个体基因型,采用Monte Carlo重抽样方法对缺失个体的基因型进行反推,进一步提出基于家系数据的X染色体Monte Carlo亲代不对称检验方法(Monte Carlo pedigree parental-asymmetry test on X chromosome,XMCPPAT)。通过模拟得到所提出方法的第一类错误率和检验效能。最后,通过一个来自北美的类风湿关节炎基因数据对新提出方法进行实例验证。(2)参考Wang等人提出的最大化似然比的检验方法,针对不同的X染色体失活模式(随机失活、偏倚失活和逃逸失活),将一个个体来自父亲和母亲的等位基因分别进行赋值。对女性的等位基因进行赋值时,用r∈[0,2]来衡量X染色体失活的偏倚程度,然后通过男性的等位基因赋值来体现X染色体是否失活。而这种赋值方式的效应量可以体现印记效应是否存在。这样可以将X染色体失活和遗传印记效应的信息同时合并到Logistic回归模型中。对不同的r值,得到不同的LR值,记为LRr。取LRr的最大值作为检验统计量,注意到其在无关联的原假设下的分布未知。所以,我们还采用了一种permutation的方法得到新提出方法的经验P值进行统计推断。相应的方法记为XCII方法(association test incorporating X chromosome inactivation and imprinting effects)。通过模拟得到所提出方法的第一类错误率和检验效能。结果:(1)在不同的模拟背景下,包括两种不同的样本量、两组不同的等位基因频率、叁种不同的近交系数和五种不同的遗传印记效应模型,模拟结果表明所提出的方法可以很好地控制第一类错误率。并且,新方法的检验效能比现有的XPAT方法要高出很多。通过Monte Carlo重抽样方法对缺失基因型进行反推,XMCPPAT方法在存在缺失基因型个体时能控制第一类错误率。再者,由于女性中近交系数的改变对XPPAT和XMCPPAT方法的结果几乎不产生影响,因而新提出的XPPAT和XMCPPAT方法不受女性中Hardy-Weinberg平衡律(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)是否成立的影响。值得注意的是,对适用于缺失数据的XMCPPAT方法,我们采用了叁种方式对等位基因频率进行处理,包括:真实的等位基因频率、由女性奠基者估算出的等位基因频率和由男性奠基者估算出的等位基因频率,将统计量分别记为XMCPPATt、XMCPPATf和XMCPPATm。另外,基于完整数据,用XPPATfull进行检验,作为所有方法的金标准。从结果上看,应用女性奠基者估算出的等位基因频率的XMCPPATf方法与基于完整数据的XPPATfull方法以及基于真实的等位基因频率的XMCPPATt方法检验效能很接近。这意味着,XMCPPATt和XMCPPATf方法可以捕获大部分缺失基因型个体的信息。然而,XMCPPATm不能很好地控制第一类错误率。(2)模拟结果表明,XCII方法可以将第一类错误率稳定在设定的显着性水平附近,说明了 XCII方法用以检验合并X染色体失活与印记效应信息的位点与疾病之间关联的有效性。在检验效能方面,当X染色体失活和遗传印记效应同时存在时,XCII方法的检验效能整体上比Wang的方法高。当仅有X染色体失活而印记效应不存在时,XCII方法的检验效能仍比Wang的方法高。因此,考虑X染色体上的关联分析研究时,我们更推荐使用第叁章新提出的XCII方法。结论:(1)新提出的XPPAT和XMCPPAT检验统计量可以有效地检验基于家系数据的X染色体质量性状位点上的印记效应,XMCPPAT方法比现有的方法检验效能更高,更适用于对包含缺失基因型个体的数据进行印记效应的检验。(2)考虑X染色体上的关联分析研究时,很多疾病同时跟X染色体失活和遗传印记效应相关联,相比只考虑X染色体失活的Wang的方法,XCII方法的表现更好。因此,我们推荐使用同时考虑X染色体失活和印记效应的XCII方法。(本文来源于《南方医科大学》期刊2017-05-10)

邹惠影[8](2016)在《猪XIST表达及X染色体失活规律的研究》一文中研究指出X染色体失活(X-chromosome inactivation,XCI)是指雌性哺乳动物会通过失活一条X染色体来达到与雄性动物性染色体基因剂量表达基本一致。XCI主要是由Xist(X-inactive specific transcript)表达调控的。XCI的发生包括随机XCI和印记XCI。小鼠和牛早期胚胎和胚外组织中会发生印记XCI;而人、马和兔等在发育过程中只发生随机XCI。XCI是一系列的表观修饰过程,可以反映重编程状态,因此XCI状态是评价胚胎干细胞(Embryonic stem cells,ESCs)、诱导多能性干细胞(Induced pluripotent stem cells,iPSCs)和体细胞核移植(Somatic cell nuclear transfer,SCNT)胚胎质量的一个重要标准。克隆胚胎的一些细胞发生异常XCI,影响X连锁基因表达进而导致克隆动物发育异常。通过降低小鼠早期克隆胚胎中Xist的表达能够显着提高克隆效率。猪同样存在克隆效率低的问题,并且目前还没得到能够生殖系嵌合的猪ES和iPS细胞,极大的限制了它们的应用。目前关于猪XIST表达和XCI的研究比较少,有必要对猪XIST的表达和XCI状态进行研究以期能提高猪克隆效率和获得真正的ES和iPS细胞。为了方便研究猪XIST,本研究通过同源比对、PCR扩增测序、3' RACE和5' RACE,找到了猪XISTRNA的完整序列。通过不同品种间的序列比对,在荣昌猪和杜洛克XIST RNA之间找到一个保守的indel位点,用于XIST印记表达分析。XIST印记表达分析结果显示猪早期胚胎和猪胎盘中即能检测到父本XIST,又能检测到母本XIST。另外,XIST差异甲基化区域(Differential methylated regions,DMRs)甲基化检测结果表明猪配子在受精之前没有携带甲基化修饰,说明猪早期胚胎不存在XIST印记表达。20天雌性正交猪和反交猪转录组测序分析显示胎盘中X连锁基因都呈双等位基因表达。因此,XIST和X连锁基因的表达都说明猪采用的是随机XCI模式。本研究通过H3K27me3免疫荧光染色观察猪克隆胚胎XCI状态,结果显示猪克隆胚胎存在异常XCI的细胞,但是异常XCI细胞比例要显着低于小鼠(5.1%-7.6%VS 20.0%-51.7%)。另外,猪囊胚期完成XCI的细胞比例低于小鼠(23%VS 80%),表明猪早期胚胎完成XCI的时间比小鼠晚。甲基化结果显示猪克隆胚胎XIST甲基化形式与体细胞类似,保留了体细胞的表观记忆。不同培养基的猪iPS细胞XIST表达和XCI分析结果显示:在2i/LIF培养体系下的猪iPS细胞不表达XIST,有两条活化的X染色体,类似于小鼠胚胎干细胞;在KOSR/bFGF培养体系下的猪iPS细胞表达XIST,有一条失活的X染色体,类似于小鼠外胚层细胞(Epiblast stem cells,EpiSCs)。综上所述,本研究通过检测XIST和X连锁基因的表达说明猪采取的是随机XCI模式。猪克隆胚胎中一些细胞发生异常XCI,但是发生异常XCI的细胞比例低于小鼠,猪克隆胚胎中保留了体细胞的修饰记忆。猪iPS细胞根据XCI状态分为两类,一种不表达XIST,有两条活化的X染色体,类似处于naive状态的小鼠干细胞;另一种表达XIST,有一条失活的X染色体,类似处于primed状态的小鼠干细胞。(本文来源于《中国农业大学》期刊2016-12-01)

杜丽丽,李晓梅,池晓东,陈敦金[9](2016)在《BDE-209暴露对人胚胎干细胞早期神经分化中X染色体失活相关基因及X连锁神经发育相关基因表达的影响》一文中研究指出目的探讨十溴联苯醚(BDE-209)暴露对人胚胎干细胞系(FY-h ES-10细胞)体外早期神经分化中X染色体失活相关基因及X连锁神经发育相关基因表达的影响。方法将FY-h ES-10细胞利用添加小分子抑制剂的方法进行神经贴壁诱导,并分别暴露于含终浓度为0(溶剂对照,DMSO浓度为1‰)、1、10、100 nmol/L BDE-209的培养基,每24 h换液1次,连续暴露11 d。收集诱导分化第11天细胞,检测细胞活性、巢蛋白(Nestin)阳性情况及X染色体失活相关基因XIST、TSIX和X连锁神经发育相关基因ATP7A、OPHN1、MAOA、PRDX4、FMR1、NLGN3的表达水平。结果各剂量BDE-209暴露组FY-h ES-10细胞神经诱导分化第11天后的细胞存活率与溶剂对照组比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。且随着BDE-209暴露剂量的升高,FY-h ES-10细胞神经诱导分化第11天后的细胞存活率呈下降趋势。与溶剂对照组比较,各剂量BDE-209暴露组FY-h ES-10诱导分化第11天细胞的Nestin阳性率均较低,差异有统计学意义(P<0.05);且随着BDE-209暴露剂量的升高,细胞Nestin阳性率呈下降趋势。与溶剂对照组相比,10、100 nmol/L BDE-209暴露组FY-h ES-10神经诱导分化第11天细胞中XIST基因的表达水平均较低,而各浓度BDE-209暴露组FY-h ES-10神经诱导分化第11天细胞中TSIX基因的表达水平均较高,差异均有统计学意义(P<0.05)。与溶剂对照组比较,10、100 nmol/L BDE-209暴露组FY-h ES-10神经诱导分化第11天细胞中MAOA和NLGN3基因的表达水平均较高,而PRDX4基因的表达水平均较低,差异均有统计学意义(P<0.05);各浓度BDE-209暴露组FY-h ES-10神经诱导分化第11天细胞中ATP7A、OPHN1、FMR1基因的表达水平均无明显改变。结论 BDE-209有可能通过影响h ESCs早期神经分化中X失活状态及X连锁神经发育相关基因表达从而产生神经发育毒性。(本文来源于《环境与健康杂志》期刊2016年09期)

林永强,李斯颖,许治强,梁燕玲,刘子凡[10](2015)在《女性脑梗死与X染色体倾斜性失活的相关性》一文中研究指出目的:探讨X染色体倾斜性失活与女性缺血性脑卒中的相关性。方法:收集缺血性脑卒中新发病例及健康对照各30例外周血标本,对标本DNA进行雄激素受体基因多态性片段分析,判断纯合性。选择杂合子的DNA进行重亚硫酸盐处理,经过甲基化PCR反应,对产物再次进行多态性片段分析。结果:缺血性脑卒中患者雄激素受体基因的纯合子比例与正常对照相近。根据卡方检验显示,缺血性脑卒中患者X染色体倾斜性失活比例较对照组明显增高。结论:缺血性脑卒中发病与X染色体倾斜性失活有高度相关性,在女性脑卒中病因学方面提供了表观遗传的证据。(本文来源于《实用医学杂志》期刊2015年21期)

染色体失活论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

X染色体失活是表观遗传学的一种特殊现象。本文以花斑猫为例,对X染色体失活的机制和相关异常进行了简要介绍。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

染色体失活论文参考文献

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论文知识图

人工诱导贝类雌核发育二倍体的原理...固定Xist,促进X染色体失活...着床前老鼠胚胎X染色体失活过程(...),核分裂指数为14个/10HPF(56个/4OHPF...一2.雌性小鼠胚胎发育过程中x染色体多重连接探针扩增技术及X染色体失活

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染色体失活论文_徐思琦
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