指纹图谱库论文_韩志强,任勇谕,夏宇飞,耿喜宁,杜康

导读:本文包含了指纹图谱库论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:图谱,指纹,多样性,种质,标记,品种,品系。

指纹图谱库论文文献综述

韩志强,任勇谕,夏宇飞,耿喜宁,杜康[1](2019)在《毛白杨多态SSR引物库和种质资源指纹图谱库构建》一文中研究指出【目的】针对毛白杨优树种质资源形态学差异小、不易区分等问题,利用多态SSR引物构建优树种质资源指纹图谱,为毛白杨种质资源管理、新品种选育、知识产权保护等提供参考。【方法】本研究以山东冠县毛白杨种质资源库469个优树无性系为对象,从毛白杨SSR多态引物筛选入手,通过荧光SSR引物PCR扩增和毛细管电泳仪检测筛选SSR引物,并构建指纹图谱。【结果】在2 317对SSR引物中,共计得到清晰、特异、多态、稳定扩增的SSR引物406对,这些SSR引物在19条染色体上的分布数量介于3~39对之间,利用BLAST比对分析可将其中389对SSR引物定位到毛果杨基因组,构建了毛白杨优树种质资源多态SSR引物库。应用多态性较高的SSR核心引物,以及特异的SSR辅助引物相结合的技术策略,筛选出25对多态性较高的SSR核心引物,以及13对特异的SSR辅助引物,构建了毛白杨种质资源库内469个优良无性系指纹图谱库,并完成了指纹图谱的QR编码。【结论】本研究成功构建了毛白杨种质资源多态SSR引物库和优树无性系指纹图谱库,对与毛白杨类似的林木种质资源遗传变异研究以及品种鉴定、系谱分析等具有重要意义。(本文来源于《北京林业大学学报》期刊2019年07期)

何家荣,王腾飞,张辰,何鸣逸[2](2019)在《中国白酒风味化学物质指纹图谱库构想及实践》一文中研究指出采用分析色谱技术,定量分析了飞天茅台、五粮液、枝江、白云边、山西汾酒、牛栏山二锅头及桂林叁花酒等5大类7种不同香型的中国白酒。将其微量化学物质按国家卫生标准、体现白酒普通香味的微量化学物质以及具有特征香味的微量化学物质分为叁大类,并按其含量和一定顺序用柱状图进行表达,从而得到其微量风味化学物质指纹图谱。尝试建立一种利用白酒微量化学物质指纹图谱鉴别白酒品质和香型的简易方法。(本文来源于《云南化工》期刊2019年01期)

李益,马先锋,唐浩,李娜,江东[3](2018)在《柑橘品种鉴定的SSR标记开发和指纹图谱库构建》一文中研究指出【目的】筛选出一套SSR核心引物,用于构建柑橘品种的DNA指纹图谱库,为柑橘种苗认证、品种登记和植物新品种保护提供技术支撑。【方法】以柑橘属8个主要栽培种类为试材进行PCR扩增,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳检测,筛选出多态性丰富、扩增条带稳定的引物对部分参试品种进行PCR扩增,扩增产物通过变性聚丙烯酰胺凝胶电泳进行进一步的引物筛选;筛选得到的引物进行荧光标记,并选用部分柑橘品种进行PCR扩增,扩增产物利用基因分析仪检测,分别计算各引物的PIC值、等位基因数目,选取一套多态性丰富的适合进行荧光毛细管电泳检测的SSR引物组合,进而对所有参试品种进行分析,构建柑橘品种的DNA指纹图谱库,同时利用筛选的SSR标记对参试品种进行鉴定。【结果】初期以柑橘属8个种的代表品种(太田椪柑、沙田柚、沅江酸橙、大红甜橙、邓肯葡萄柚、枸橼、费米耐劳柠檬和墨西哥来檬)为材料,用362对SSR引物进行PCR扩增,扩增产物经4%琼脂糖凝胶电泳检测,初步筛选出80对种间多态性高、扩增稳定的SSR引物;进一步从8个种类里选择不同类型的64个柑橘品种,用上述筛选出的80对SSR引物进行PCR扩增,扩增产物经6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,再筛选出60对品种类型间多态性高、扩增稳定、条带清晰的SSR引物,并分别进行荧光标记;另以168份柑橘品种为材料对上述60对SSR引物进行PCR扩增,经荧光毛细管电泳检测,依据各引物的PIC值、等位基因数目、峰图读取难易程度、扩增稳定性及染色体位置等,最终筛选出21对SSR引物作为指纹图谱库构建的核心引物。为消除不同仪器、不同试验批次等引起的误差,为21对SSR引物各主要等位变异选择相应的参照品种。根据各引物标记的荧光颜色及扩增片段大小进行合理组合,21对SSR引物可分成5组进行多重电泳,共采集500份柑橘品种的DNA指纹。利用SSR标记,有111份品种仅用1对引物即可鉴别,86份品种用2对引物组合即可鉴别,24份品种用3对引物组合即可鉴别,另外279份品种虽无法单独一一鉴别,但可分为87个小组,组内品种无法区分,组间品种易鉴别。【结论】利用筛选出的21对SSR核心引物,构建了包含500份柑橘品种的DNA指纹图谱库,筛选出部分品种的特异标记,可以鉴别221份柑橘品种和87个品种组合,构建了基于毛细管电泳平台的柑橘SSR分子标记品种鉴定体系。(本文来源于《中国农业科学》期刊2018年15期)

何萌[4](2018)在《我区科研人员用分子指纹图谱库给薰衣草做“亲子鉴定”》一文中研究指出薰衣草是一种具有较高经济价值的天然香料,在我区伊犁河谷种植面积较大。然而在种植过程中,薰衣草缺乏系统的品系分类方法,使薰衣草品种存在命名不规范、同名异物或同物异名的现象,限制了薰衣草优良品种的创新和选育。如何给薰衣草的品种鉴定提供准确的依据呢?(本文来源于《新疆科技报(汉)》期刊2018-05-11)

何萌,朱彤[5](2018)在《分子指纹图谱库让薰衣草有了“亲子鉴定”》一文中研究指出科技日报乌鲁木齐5月8日电 (何萌 记者朱彤)风吹起一整片薰衣草田,宛如紫色的波浪上下起伏。每年6月上旬,一睹薰衣草花海的游客络绎不绝。游客谁说得清引进薰衣草50年后品种变异了吗?同样当过游客的新疆农业大学农学院副教授苏秀娟团队说得清。5月8日(本文来源于《科技日报》期刊2018-05-09)

王世强,王立儒,刘帅,牛俊峰,冯书超[6](2018)在《基于SSR标记的黄精品种(系)DNA指纹图谱库构建》一文中研究指出为了开展药用黄精种质资源的分子标记育种工作,实现对黄精品种及优良种质的快速精准鉴定。本研究采用12对引物对32个野生黄精种质材料进行SSR多态位点分析,之后计算相似系数并进行聚类分析,然后构建DNA指纹图谱及其QR编码。结果表明:12对引物共扩增出127条条带,其中多样性条带125条,多态率为98.43%,每对核心引物检测到的多样性条带数为3~17条,平均每对为10.42条,PIC(多样性信息含量)平均为0.46。其中等位基因数为1.984 3,有效等位基因数为1.527 8,Nei's基因多样性为0.314 9,Shannon's指数为0.478 8。SSR聚类结果很好的反映供试黄精材料的亲缘关系,所构建的DNA指纹图谱能对所有的种质材料进行高效区分。QR编码高效、方便的录入大量信息,有利于黄精品种及优良种质的鉴定工作。该体系的建立为黄精种质资源遗传多样性分析及品种保护、优良品种选育、优良种质鉴定提供依据。(本文来源于《分子植物育种》期刊2018年06期)

[7](2016)在《国家疫苗生产菌种全基因组序列及蛋白指纹图谱库的建设和应用》一文中研究指出该项目为国家“重大新药创制”专项,由中检院生物制品检定所相关实验室,军事医学科学院放射与辐射医学研究所,军事医学科学院微生物流行病研究所等共同承担。主要目标是针对当前我国创新生物药的研发现状,在国际上率先构建我国疫苗类药品生产用菌种的全基因组和蛋白数据库(本文来源于《中国医药报》期刊2016-05-30)

刘娟,廖康,曼苏尔·那斯尔,孙琪,刘欢[8](2015)在《新疆杏品种(系)遗传多样性分析及DNA指纹图谱库构建》一文中研究指出【目的】从ISSR分子标记水平分析新疆主栽杏品种(系)的遗传多样性和亲缘关系,构建新疆杏品种(系)的DNA指纹图谱数据库,为杂交育种、品种鉴定和品种分类提供理论依据。【方法】从供试样品中选取表型差异较大的6份材料对100个ISSR引物进行筛选,最终筛选出条带清晰、主带明显、多态性丰富、能够稳定重复且对品种具有较高鉴别力的ISSR特征引物,对48个新疆杏品种(系)进行扩增,采用POPGENE version 1.32软件计算多态性位点数、多态性位点百分率、观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s多样性指数(H)和Shannon信息指数(I),及各材料间的Nei’s遗传相似系数(GS)和遗传距离(GD),并利用NTSYS pc version2.10e软件根据Nei’s遗传相似系数采用UPGMA方法进行聚类,以此分析遗传多样性和亲缘关系;利用4个引物特异位点的不同组合及Gel2.0指纹图谱自动识别系统鉴别48个新疆主栽杏品种(系),并利用Gel2.0构建主栽杏品种(系)的DNA指纹图谱库。【结果】从100个ISSR引物中筛选到重复性好、多态性丰富的4个引物作为特征引物,分别为UBC809、UBC836、UBC844和UBC850,共扩增出78个位点,其中73个为多态性位点,平均多态性位点百分率为93.13%,其中引物UBC844多态性位点百分率最高,为100.00%;48个新疆主栽杏品种(系)的观测等位基因数、有效等位基因数、Nei’s基因多样性和Shannon信息指数的平均值分别为1.9313、1.4368、0.2622和0.4028,说明各品种(系)的遗传多样性相对较丰富。‘黄肉油杏’和‘大五月杏’的遗传相似系数为0.8846,遗传距离为0.1226;‘库曼提’和‘索格佳娜丽’的遗传相似系数为0.5641,遗传距离为0.5725。将4个引物两两组合起来,可快速、准确地鉴别46个杏品种(系),只有‘辣椒杏’和‘伊犁阿克玉吕克’需要3个引物组合才能鉴别出来,利用这4个ISSR特征引物通过Gel2.0指纹图谱自动识别系统构建了48个杏品种(系)的DNA标准指纹图谱数据库。【结论】新疆主栽杏品种(系)的遗传多样性较丰富,亲缘关系相对较近,‘黄肉油杏’和‘大五月杏’的亲缘关系最近,‘库曼提’和‘索格佳娜丽’的亲缘关系最远;且ISSR标记适于新疆主栽杏品种的遗传多样性、亲缘关系分析及构建DNA指纹图谱库;指纹图谱库的建立为杏品种(系)的鉴定及品种真实性和纯度奠定了基础,为新品种登记、注册和品种知识产权保护等提供科学依据。(本文来源于《中国农业科学》期刊2015年04期)

邓姗,褚云霞,黄志城,杨华,顾可飞[9](2015)在《上海地区水稻已知品种SSR指纹图谱库构建》一文中研究指出用24对引物构建上海地区53份水稻品种的DNA指纹图谱,为当地水稻新品种保护、遗传资源评价及亲缘关系分析提供理论依据和技术支持。结果显示,试验中共检测出109条多态性片段,变幅2~9条,平均每对引物4.5417条多态性片段,有效等位基因数为70.8187,平均每个标记2.9508个;Shannon多样性指数(Ⅰ)平均值为1.1296,变幅0.4949~1.8402;多态性信息含量(PIC)平均值为0.5415,变幅0.2656~0.8001。用24个标记建立53份材料的DNA指纹图谱,这些字符串就构成了这53份材料的"身份证号码",本试验中,各材料的分子身份证号码是唯一的;聚类分析表明,在遗传相似系数0.21处可以将53份材料分为2个类群,分别为粳稻组和籼稻组,但是组内遗传距离较近。由此可见,上海地区水稻品种的遗传多样性相对狭窄。(本文来源于《中国农学通报》期刊2015年03期)

李瑞峰[10](2014)在《甜瓜主栽品种指纹图谱库的构建及遗传多样性分析》一文中研究指出甜瓜是世界人民备受喜爱的水果型蔬菜,在我国农村经济中占有重要地位。随着改革开放的深入,国家对瓜果生产由计划经济改为产销放开、市场调节,这一政策全面促进了甜瓜产业的迅速发展。目前,新育成的甜瓜品种数在逐年增加,涌入市场的新品种不计其数。随着新育成品种的不断增加,骨干亲本的重复使用,新基因资源的缺乏,新育成品种的鉴定难度逐渐增大;加之当前国内甜瓜种子市场尚不够规范,一些单位受商业利益驱动篡改品种名称、盗用新育成品种名称,导致中国甜瓜市场品种普遍存在着由于同名异物或同物异名现象导致的品种真实性问题,各地出现由品种真实性引起的纠纷事件不断。为解决甜瓜新育成品种的鉴定问题与品种真实性引起的种子纠纷事件,急需建立我国甜瓜品种的核酸指纹库,为品种纯度与真实性鉴定提供技术支撑。本试验收集了235个国内甜瓜主栽品种,采用形态学标记和SSR标记技术,分别从形态特性及遗传物质的特异性两方面研究供试235个甜瓜品种的遗传多样性,并为235个甜瓜品种构建了指纹图谱库,为我国甜瓜公共指纹数据库的构建提供理论依据和技术支撑。采用形态学标记,观察的14个果实性状中,平均变异系数为0.17。其中芳香气变异系数最大,为0.46。基于对上述14个形态学性状的聚类分析,得到235个品种的聚类分析图,235个品种之间的遗传相似系数变幅为0.73-0.96。对60个品种二次聚类,相似系数为0.73-0.94,在相似系数为0.74处,60个甜瓜品种被分为2组,一组为13份厚皮甜瓜,另一组是46份薄皮甜瓜和1份厚皮甜瓜。利用18对引物,用于235个甜瓜品种的多样性分析,共得到5050条清晰可辨条带,其中多态性条带157条。每对引物可以检测到4-14条数目不等的多态性条带,平均为9条。多态性信息含量(PIC)平均为0.71,变化范围为0.57-0.87。所有供试品种由18对核心引物扩增得到的157个位点,对所有供试品种进行聚类分析。结果表明,品种间的相似系数变幅在0.69-0.99之间。对60个甜瓜供试品种进行二次聚类,构建了60个品种聚类分析图。图中可以看出所有供试品种遗传相似系数的变化范围在0.75-0.95之间。当相似系数在0.77时,可以将所有供试品种分为6类,包括来自不同地区的3类厚皮甜瓜和3类薄皮甜瓜,与形态学聚类分析结果基本一致,较形态学标记分类更为细致。235个甜瓜品种经过18对引物扩增后,每个品种建立自己的指纹图谱代码。比较每个品种建立的指纹代码,发现其中有26个品种指纹代码不唯一,这26个品种分为10组,每组里的品种指纹代码相同。26份指纹代码不唯一的品种占所有供试品种的12%,鉴别率达88%。利用QR精灵对5个品种进行编码,其中包含了品种的名称、来源地、果皮底色、果肉颜色、糖度、肉质、类型等直观性状及SSR分子标记的指纹图谱代码等信息,得到的二维码简洁方便,本试验提供了编码需要的所有信息,可以为每个品种构建了一份指纹图谱编码。(本文来源于《东北农业大学》期刊2014-06-01)

指纹图谱库论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

采用分析色谱技术,定量分析了飞天茅台、五粮液、枝江、白云边、山西汾酒、牛栏山二锅头及桂林叁花酒等5大类7种不同香型的中国白酒。将其微量化学物质按国家卫生标准、体现白酒普通香味的微量化学物质以及具有特征香味的微量化学物质分为叁大类,并按其含量和一定顺序用柱状图进行表达,从而得到其微量风味化学物质指纹图谱。尝试建立一种利用白酒微量化学物质指纹图谱鉴别白酒品质和香型的简易方法。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

指纹图谱库论文参考文献

[1].韩志强,任勇谕,夏宇飞,耿喜宁,杜康.毛白杨多态SSR引物库和种质资源指纹图谱库构建[J].北京林业大学学报.2019

[2].何家荣,王腾飞,张辰,何鸣逸.中国白酒风味化学物质指纹图谱库构想及实践[J].云南化工.2019

[3].李益,马先锋,唐浩,李娜,江东.柑橘品种鉴定的SSR标记开发和指纹图谱库构建[J].中国农业科学.2018

[4].何萌.我区科研人员用分子指纹图谱库给薰衣草做“亲子鉴定”[N].新疆科技报(汉).2018

[5].何萌,朱彤.分子指纹图谱库让薰衣草有了“亲子鉴定”[N].科技日报.2018

[6].王世强,王立儒,刘帅,牛俊峰,冯书超.基于SSR标记的黄精品种(系)DNA指纹图谱库构建[J].分子植物育种.2018

[7]..国家疫苗生产菌种全基因组序列及蛋白指纹图谱库的建设和应用[N].中国医药报.2016

[8].刘娟,廖康,曼苏尔·那斯尔,孙琪,刘欢.新疆杏品种(系)遗传多样性分析及DNA指纹图谱库构建[J].中国农业科学.2015

[9].邓姗,褚云霞,黄志城,杨华,顾可飞.上海地区水稻已知品种SSR指纹图谱库构建[J].中国农学通报.2015

[10].李瑞峰.甜瓜主栽品种指纹图谱库的构建及遗传多样性分析[D].东北农业大学.2014

论文知识图

2 柑橘栽培品种(系)DNA指纹图谱库改变样本量指纹图谱库判别分析...秦皮药材的指纹谱图1 某同一档次不同批次白酒的指纹图谱纵...批鸡胆粉的HPLC指纹图谱特征峰数据的层次聚类树图

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指纹图谱库论文_韩志强,任勇谕,夏宇飞,耿喜宁,杜康
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